基因页：PDXDC1
概括？
| 基因 | 23042 |
| 象征 | PDXDC1 |
| 同义词 | LP8165 |
| 描述 | 吡啶还毒素依赖性脱羧酶结构域，含有1个 |
| 参考 | MIM：614244|HGNC：HGNC：28995|ENSEMBL：ENSG00000179889|HPRD：13789|Vega：Otthumg00000166304 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 16p13.11 |
| Pascal P值 | 2.056e-5 |
| 支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） | PSR：0.01775 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| heatr5b | 0.95 | 0.97 |
| kif2a | 0.94 | 0.96 |
| USP15 | 0.94 | 0.95 |
| EHBP1 | 0.93 | 0.95 |
| WDR47 | 0.93 | 0.96 |
| papd5 | 0.93 | 0.95 |
| clasp2 | 0.93 | 0.95 |
| rufy3 | 0.92 | 0.96 |
| aasdhppt | 0.92 | 0.94 |
| arfgef1 | 0.92 | 0.94 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| FXYD1 | -0.77 | -0.85 |
| AF347015.31 | -0.77 | -0.85 |
| MT-CO2 | -0.76 | -0.86 |
| HSD17B14 | -0.76 | -0.82 |
| AF347015.33 | -0.75 | -0.82 |
| TSC22D4 | -0.75 | -0.82 |
| higd1b | -0.74 | -0.86 |
| ifi27 | -0.74 | -0.84 |
| Metrn | -0.74 | -0.87 |
| AF347015.8 | -0.73 | -0.84 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 17353931 | |
| GO：0016829 | 裂解酶活性 | IEA | - | |
| GO：0016831 | 羧基活性 | IEA | - | |
| 去：0030170 | 吡啶还毒素结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0019752 | 羧酸代谢过程 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 渡边直肠癌放疗反应能力 | 108 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN | 463 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 乳腺癌腔与间充质 | 450 | 256 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindgren膀胱癌簇1 DN | 378 | 231 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Darwiche皮肤肿瘤启动子DN | 185 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Darwiche Papilloma风险低 | 162 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Darwiche Papilloma风险高DN | 180 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| darwiche鳞状细胞癌DN | 181 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 里克曼转移 | 344 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Stark前额叶皮层22Q11删除DN | 517 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL顺式 | 128 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chesler Brain QTL顺式 | 75 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血细胞和脑QTL Trans | 185 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血细胞和脑QTL顺式 | 65 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 切斯勒大脑最高遗传差异 | 37 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn | 546 | 351 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MLL AF9融合的Kumar目标 | 405 | 264 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| coates巨噬细胞M1与M2 DN | 78 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Massarweh tamoxifen抗性 | 578 | 341 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yokoe Cancer testis抗原 | 38 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 营地结肠癌拷贝编号DN | 74 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mir34b和Mir34C的丰田目标 | 463 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bredemeyer抹布信令不是通过ATM DN | 57 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bredemeyer抹布通过ATM而不是通过NFKB DN发出的信号 | 38 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kyng Werner综合征和正常老化DN | 225 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-182 | 1583年 | 1590年 | 1A，M8 | HSA-MIR-182 | uuuggcaaugguagaacucaca |
| mir-96 | 1584年 | 1590年 | 1a | HSA-MIR-96脑 | uuuggcacuagcacauuuuugc |