概括
基因 23043
象征 tnik
同义词 -
描述 TRAF2和NCK相互作用激酶
参考 MIM:610005|HGNC:HGNC:30765|ENSEMBL:ENSG00000154310|HPRD:18206|Vega:Otthumg00000159036
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3Q26.31
Pascal P值 0.044
Sherlock P值 0.174
胎儿β 0.814
主持人 海马
支持 COMPOSITESET
Darnell FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:0.3428

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
XXBAC-B461K10.1 0.92 0.92
vash1 0.91 0.91
VHL 0.91 0.91
BTBD12 0.90 0.92
micall1 0.90 0.89
三人组 0.90 0.90
clip2 0.90 0.92
mllt1 0.89 0.92
axin1 0.89 0.90
ZCCHC14 0.89 0.91
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.71 -0.82
C5orf53 -0.68 -0.70
MT-CO2 -0.67 -0.79
AF347015.27 -0.66 -0.76
B2M -0.66 -0.74
HLA-F -0.66 -0.68
COPZ2 -0.66 -0.74
FXYD1 -0.65 -0.75
ifi27 -0.65 -0.75
higd1b -0.65 -0.79

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0005083 小型GTPase调节剂活性 IEA -
去:0005524 ATP结合 nas -
去:0004674 蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 艾达 10521462
去:0004674 蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 nas -
GO:0016740 转移酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006468 蛋白氨基酸磷酸化 nas -
去:0007254 JNK级联 塔斯 -
去:0007243 蛋白激酶级联反应 艾达 10521462
去:0006950 对压力的反应 艾达 10521462
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005575 cellular_component nd -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PID TNF途径 46 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Beta Catenin nuc途径 80 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX FOXO1融合DN的Davicioni目标DN 68 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS 579 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Deurig t细胞促进性白血病DN 320 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多恩乳腺癌课程 72 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gal白血病干细胞向上 133 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mohankumar TLX1靶向DN 193 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向 769 437 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fab M7类型的Ross Aml 68 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 681 420 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggins他莫昔芬抗性 66 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Acevedo肝癌,H3K27me3 UP 295 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞 425 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Firestein增殖 175 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹间皮瘤生存DN 12 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoelzel NF1靶向 139 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标2 UP 140 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 ETS融合DN的Miyagawa目标 229 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
杨Bcl3靶向 364 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
phong tnf响应不是通过p38 337 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
前列腺癌模型中的Acevedo FGFR1靶标 289 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因