基因页面:NCOA6
总结吗?
| GeneID | 23054年 |
| 象征 | NCOA6 |
| 同义词 | AIB3 | ASC2 | NRC | PRIP | RAP250 | TRBP |
| 描述 | 核受体共激活剂6 |
| 参考 | MIM: 605299|HGNC: HGNC: 15936|运用:ENSG00000198646|HPRD: 05599|织女:OTTHUMG00000032311 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 20的事情 |
| 帕斯卡假定值 | 0.017 |
| 夏洛克假定值 | 0.142 |
| eGene | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 伏隔核基底神经节 硬膜基底神经节 |
| 支持 | CompositeSet 达内尔FMRP目标 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs2024632 | 20. | 33465572 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 5.368 e-6 | 0 | -52120年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6087641 | 20. | 33467717 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 1.126 e-6 | 0 | -54265年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6087642 | 20. | 33468306 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 4.986 e-6 | 0 | -54854年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs1013677 | 20. | 33468793 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 1.124 e-6 | 0 | -55341年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6088636 | 20. | 33469746 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 1.124 e-6 | 0 | -56294年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4911163 | 20. | 33470694 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 1.124 e-6 | 0 | -57242年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6088640 | 20. | 33472509 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 1.124 e-6 | 0 | -59057年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6087643 | 20. | 33474462 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 1.124 e-6 | 0 | -61010年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs1060615 | 20. | 33478381 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 1.124 e-6 | 0 | -64929年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4911447 | 20. | 33479445 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 1.124 e-6 | 0 | -65993年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6088642 | 20. | 33483186 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 1.124 e-6 | 0 | -69734年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6119542 | 20. | 33484545 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 1.232 e-6 | 0 | -71093年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6119543 | 20. | 33484757 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 4.093 e - | 0 | -71305年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs8123210 | 20. | 33486047 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 2.983 e-6 | 0 | -72595年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6087646 | 20. | 33486048 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 4.452 e - | 0 | -72596年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6120756 | 20. | 33486596 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 1.124 e-6 | 0 | -73144年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2207147 | 20. | 33488013 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 1.124 e-6 | 0 | -74561年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6120757 | 20. | 33488771 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 4.482 e-6 | 0 | -75319年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs397864422 | 20. | 33489906 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 1.259 e - | 0 | -76454年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs926734 | 20. | 33491700 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 6.553 e - | 0 | -78248年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6120758 | 20. | 33492523 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 1.124 e-6 | 0 | -79071年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7266550 | 20. | 33495510 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 1.124 e-6 | 0 | -82058年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2378293 | 20. | 33499052 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 1.668 e-6 | 0 | -85600年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3787214 | 20. | 33500245 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 1.124 e-6 | 0 | -86793年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2378294 | 20. | 33500378 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 1.124 e-6 | 0 | -86926年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6088646 | 20. | 33505937 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 1.124 e-6 | 0 | -92485年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6120763 | 20. | 33506400 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 1.124 e-6 | 0 | -92948年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2076667 | 20. | 33506964 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 1.124 e-6 | 0 | -93512年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3746450 | 20. | 33508588 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 1.124 e-6 | 0 | -95136年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3818273 | 20. | 33509275 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 1.124 e-6 | 0 | -95823年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6087649 | 20. | 33510662 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 1.124 e-6 | 0 | -97210年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4911449 | 20. | 33512236 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 1.124 e-6 | 0 | -98784年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4911451 | 20. | 33512466 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 1.124 e-6 | 0 | -99014年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6088650 | 20. | 33514465 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 1.124 e-6 | 0 | -101013年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs725521 | 20. | 33516071 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 1.124 e-6 | 0 | -102619年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6087651 | 20. | 33518353 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 1.124 e-6 | 0 | -104901年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6088653 | 20. | 33520321 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 1.124 e-6 | 0 | -106869年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6087652 | 20. | 33520802 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 5.012 e-6 | 0 | -107350年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6087653 | 20. | 33522054 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 1.124 e-6 | 0 | -108602年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6087654 | 20. | 33522142 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 1.124 e-6 | 0 | -108690年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6119545 | 20. | 33522869 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 1.124 e-6 | 0 | -109417年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4911452 | 20. | 33526983 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 5.453 e-6 | 0 | -113531年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6088655 | 20. | 33527838 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 1.151 e-6 | 0 | -114386年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3761143 | 20. | 33545745 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 5.768 e-6 | 0 | -132293年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6088664 | 20. | 33551100 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 5.746 e-6 | 0 | -137648年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3761141 | 20. | 33737824 | NCOA6 | ENSG00000198646.9 | 6.148 e-6 | 0 | -324372年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ZFYVE20 | 0.96 | 0.96 |
| TGFBRAP1 | 0.95 | 0.96 |
| FOXK2 | 0.95 | 0.95 |
| DIP2C | 0.94 | 0.95 |
| USP22 | 0.94 | 0.94 |
| CLIP2 | 0.93 | 0.94 |
| RAPGEF1 | 0.93 | 0.94 |
| SEC16A | 0.93 | 0.94 |
| PRDM15 | 0.93 | 0.94 |
| SLC35E1 | 0.93 | 0.94 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.71 | -0.78 |
| MT-CO2 | -0.69 | -0.77 |
| AF347015.21 | -0.68 | -0.84 |
| AF347015.27 | -0.68 | -0.74 |
| FXYD1 | -0.68 | -0.73 |
| HIGD1B | -0.67 | -0.75 |
| AF347015.33 | -0.66 | -0.70 |
| C1orf54 | -0.66 | -0.83 |
| AF347015.8 | -0.66 | -0.75 |
| MT-CYB | -0.65 | -0.72 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0003682 | 染色质绑定 | 国际空间站 | - - - - - - | |
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 11443112 | |
| 去:0030331 | 雌激素受体结合 | 助教 | 11443112 | |
| 去:0030374 | ligand-dependent核受体转录辅激活活动 | 新闻学会 | 11443112 | |
| 去:0046965 | 类维生素a X受体结合 | 助教 | 11443112 | |
| 去:0046966 | 甲状腺激素受体结合 | 艾达 | 11443112 | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0007420 | 大脑发育 | 国际空间站 | 大脑(术语层面:7) | - - - - - - |
| 去:0001701 | 在子宫内胚胎发育 | 国际空间站 | - - - - - - | |
| 去:0006355 | 依赖dna的转录调节 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006367 | 从RNA聚合酶II启动子转录起始 | 国际空间站 | - - - - - - | |
| 去:0030520 | 雌激素受体信号通路 | NAS | 11443112 | |
| 去:0030099 | 髓系细胞分化 | 艾达 | 11302752 | |
| 去:0006350 | 转录 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006310 | DNA重组 | NAS | 11443112 | |
| 去:0006281 | DNA修复 | NAS | 11443112 | |
| 去:0006260 | DNA复制 | NAS | 11443112 | |
| 去:0009725 | 对激素的刺激做出反应 | 助教 | 11443112 | |
| 去:0007507 | 心发展 | 国际空间站 | - - - - - - | |
| 去:0042921 | 糖皮质激素受体信号通路 | NAS | 11443112 | |
| 去:0045944 | 积极的监管RNA聚合酶II启动子的转录 | 艾达 | 11443112 | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005634 | 核 | 艾达 | 11443112 | |
| 去:0005634 | 核 | NAS | 10567404 | |
| 去:0005667 | 转录因子复杂 | 助教 | 11443112 | |
| 去:0005730 | 核仁 | 艾达 | 18029348 |
第四部分,注释蛋白质间交互作用
| 扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| 基于“增大化现实”技术 | AIS | DHTR | HUMARA | KD | NR3C4 | SBMA | SMAX1 |解冻 | 雄性激素受体 | 亲和力Capture-Western 2台混合动力 |
BioGRID | 14645241 |
| ASCC1 | ASC1p50 | CGI-18 | rp11 - 150 d20.4 | 激活信号cointegrator 1复杂的亚基1 | 重新组成复杂 | BioGRID | 10567404 |
| ASCL2 | ASH2 | HASH2 | MASH2 | bHLHa45 | achaete-scute复杂同族体2(果蝇) | 亲和力Capture-MS 亲和力Capture-Western Co-purification |
BioGRID | 12482968 |
| ATF2 | CRE-BP1 | CREB2 | HB16 | MGC111558 | TREB7 | 激活转录因子2 | 亲和力Capture-Western Co-localization 重新组成复杂 2台混合动力 |
BioGRID | 14734562 |
| BCL3 | BCL4 | D19S37 | b细胞慢性淋巴细胞白血病/淋巴瘤3 | 重新组成复杂 | BioGRID | 10497212 |
| CD40 | Bp50 | CDW40 | MGC9013 | TNFRSF5 | p50 | CD40分子,肿瘤坏死因子受体超家族成员5 | 重新组成复杂 | BioGRID | 10847592 |
| CEBPA | C / EBP-alpha | CEBP | CCAAT /增强子结合蛋白(C / EBP),α | ASC-2与C / EBPα。 | 绑定 | 11302752 |
| CEBPA | C / EBP-alpha | CEBP | CCAAT /增强子结合蛋白(C / EBP),α | 亲和力Capture-Western Co-localization 2台混合动力 |
BioGRID | 11302752|14734562 |
| CREBBP | 海关与边境保护局| KAT3A | rst | 结合蛋白分子 | 重新组成复杂 2台混合动力 |
BioGRID | 10567404|11158331 |
| CXADR | 汽车| HCAR | 柯萨奇病毒和腺病毒受体 | 重新组成复杂 | BioGRID | 15764585 |
| E2F1 | E2F-1 | RBAP1 | RBBP3 | RBP3 | E2F转录因子1 | 亲和力Capture-Western 重新组成复杂 2台混合动力 |
BioGRID | 14638867 |
| EP300 | KAT3B | p300 | E1A结合蛋白p300 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10823961 |
| ESR1 | ER DKFZp686N23123 | | ESR |将有关| |时代NR3A1 | 雌激素受体1 | 重新组成复杂 2台混合动力 |
BioGRID | 10567404|11158331 |11773444 |
| ESR2 | ER-BETA | ESR-BETA |分级| ESTRB | Erb | NR3A2 | 雌激素受体2 (ERβ) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11773444 |
| FGR | FLJ43153 | MGC75096 | SRC2 | c-fgr | c-src2 | p55c-fgr | p58c-fgr | Gardner-Rasheed猫肉瘤病毒致癌基因相同器官(v-fgr) | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 12482968 |
| ”丛书 | AP-1 | C-FOS | v-fos FBJ小鼠骨肉瘤病毒致癌基因相同器官 | 重新组成复杂 | BioGRID | 10847592 |
| GTF2A1 | MGC129969 | MGC129970 | TF2A1 | TFIIA | 通用转录因子活动花絮,1,19/37kDa | 重新组成复杂 | BioGRID | 10567404 |
| HBXIP | MGC71071 | XIP | 乙肝病毒x)相互作用的蛋白质 | 亲和力Capture-Western 重新组成复杂 2台混合动力 |
BioGRID | 14578865 |
| HIST2H3C | H3 | H3.2 | H3 / M | H3F2 | H3FM | MGC9629 | 组蛋白集群2,H3c | 亲和力Capture-Western 重新组成复杂 |
BioGRID | 12482968 |
| HSAJ2425 | p65 | p65蛋白 | 重新组成复杂 | BioGRID | 10847592 |
| HSF1 | HSTF1 | 热休克转录因子1 | 亲和力Capture-Western Co-localization |
BioGRID | 14960326 |
| HSF1 | HSTF1 | 热休克转录因子1 | ASC-2与HSF1交互。 | 绑定 | 14960326 |
| 小君 | AP-1 | AP1 | c-Jun | 小君致癌基因 | 重新组成复杂 | BioGRID | 10847592 |
| MED23 | CRSP130 | CRSP133 | CRSP3 | DKFZp434H0117 | DRIP130 | SUR2 | 中介复杂的亚基23 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10823961 |
| MLL3 | DKFZp686C08112 | FLJ12625 | FLJ38309 | HALR | KIAA1506 | KMT2C | MGC119851 | MGC119852 | MGC119853 | 骨髓/淋巴或mixed-lineage白血病3 | 亲和力Capture-MS 亲和力Capture-Western Co-purification |
BioGRID | 12482968 |
| NFKB1 | DKFZp686C01211 | EBP-1 | KBF1 | MGC54151 | NF-kappa-B | NFKB-p105 | NFKB-p50 |施敏原著 | 核因子k光多肽基因增强剂b细胞1 | 重新组成复杂 | BioGRID | 10847592 |
| NR1H2 | LXR-b | LXRB |尼珥| NER-I | RIP15 |老 | 核受体亚科1 H组,成员2 | 重新组成复杂 2台混合动力 |
BioGRID | 11158331|15764585 |
| NR3C1 | GCCR | GCR | GR | GRL | 核受体亚科3 C组,成员1(糖皮质激素受体) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10567404 |
| NUMA1 | NUMA | 核有丝分裂器1的蛋白质 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12519782 |
| PARP1 | ADPRT | ADPRT1 | PARP | PARP-1 | PPOL | pADPRT-1 | 保利(ADP-ribose)聚合酶1 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 12519782 |
| PPARA | MGC2237 | MGC2452 | NR1C1 | PPAR | hPPAR | 过氧物酶体proliferator-activated受体α | 2台混合动力 | BioGRID | 11158331 |
| PPARG | NR1C3 | PPARG1 | PPARG2 | PPARgamma | 过氧物酶体proliferator-activated受体γ | - - - - - - | HPRD | 10788465 |
| PPARG | NR1C3 | PPARG1 | PPARG2 | PPARgamma | 过氧物酶体proliferator-activated受体γ | 2台混合动力 | BioGRID | 11158331 |
| PRKDC | DNA-PKcs | DNAPK | DNPK1 | HYRC | HYRC1 | XRCC7 | p350 | 蛋白激酶、DNA-activated催化多肽 | 亲和力Capture-MS 生化活动 |
BioGRID | 10823961 |
| PRMT2 | HRMT1L1 | MGC111373 | 蛋白质精氨酸甲基转移酶2 | PRMT2与PRIP交互。 | 绑定 | 12039952 |
| RARA | NR1B1 | RAR | 视黄酸受体α | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10567404 |
| RB1 | OSRC | RB | p105-Rb |复审委员会| pp110 | 成视网膜细胞瘤1 | Rb与ASC-2交互。 | 绑定 | 14645241 |
| RB1 | OSRC | RB | p105-Rb |复审委员会| pp110 | 成视网膜细胞瘤1 | 亲和力Capture-Western 重新组成复杂 2台混合动力 |
BioGRID | 14645241 |
| RBBP5 | RBQ3 | SWD1 | 视网膜母细胞瘤结合蛋白5 | 亲和力Capture-MS 亲和力Capture-Western Co-purification |
BioGRID | 12482968 |
| RBM14 | COAA | DKFZp779J0927 | MGC15912 | MGC31756 | PSP2 SIP | | SYTIP1 | TMEM137 | RNA结合主题蛋白14 | - - - - - - | HPRD | 11443112 |
| RBM39 | 刺山柑花蕾| CAPERalpha | CC1.3 | DKFZp781C0423 | FLJ44170 | HCC1 | RNPC2 | fSAP59 | RNA结合主题蛋白质39 | - - - - - - | HPRD | 11704680 |
| RELA | MGC131774 | NFKB3 | p65 | v-rel reticuloendotheliosis病毒致癌基因相同器官(禽流感) | 重新组成复杂 | BioGRID | 10847592 |
| RXRA | FLJ00280 | FLJ00318 | FLJ16020 | FLJ16733 | MGC102720 | NR2B1 | 类维生素a X受体α | 亲和力Capture-Western 重新组成复杂 2台混合动力 |
BioGRID | 10567404|11158331 |11773444|14578865 |
| SRC | c - src ASV | SRC1 | | p60-Src | v - src肉瘤(Schmidt-Ruppin a)病毒致癌基因相同器官(禽流感) | 亲和力Capture-Western 重新组成复杂 2台混合动力 |
BioGRID | 10567404|10847592 |11158331|12482968 |
| SRF | MCM1 | 血清反应因子(c-fos血清反应元件结合转录因子) | 重新组成复杂 | BioGRID | 10847592 |
| 真沸点 | GTF2D | GTF2D1 | MGC117320 | MGC126054 | MGC126055 | SCA17 | TFIID | TATA盒结合蛋白 | 重新组成复杂 | BioGRID | 10567404 |
| TGS1 | DKFZp762A163 | FLJ22995 | NCOA6IP | PIMT | PIPMT | trimethylguanosine合成酶同族体(酵母) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11517327 |
| THRA | AR7 | EAR7 | ERB-T-1 | ERBA | ERBA1 | MGC000261 | MGC43240 | NR1A1 | THRA1 | THRA2 | c-ERBA-1 | 甲状腺激素受体α(erythroblastic白血病病毒(v-erb-a)致癌基因相同器官,鸟类) | 亲和力Capture-Western 重新组成复杂 2台混合动力 |
BioGRID | 10567404|10847592 |11158331 |
| THRB | ERBA-BETA | ERBA2 | GRTH | MGC126109 | MGC126110 | NR1A2 | PRTH | THR1 | THRB1 | THRB2 | 甲状腺激素受体β(erythroblastic白血病病毒(v-erb-a)致癌基因同族体2,鸟类) | 重新组成复杂 2台混合动力 |
BioGRID | 10567404|10823961 |11158331|11773444 |
| TUBA4A | FLJ30169 | H2-ALPHA | TUBA1 | 微管蛋白、α4 | 亲和力Capture-MS Co-purification |
BioGRID | 12482968 |
| TUBB | M40 | MGC117247 | MGC16435 |好吧/ SW-cl。56 | TUBB1 | TUBB5 | 微管蛋白,β | 亲和力Capture-MS Co-purification |
BioGRID | 12482968 |
| XRCC5 | FLJ39089 | KARP-1 | KARP1 | KU80 | KUB2 | Ku86 | NFIV | x射线在中国仓鼠细胞修复补充缺陷修复5 (double-strand-break重新加入) | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 10823961|12519782 |
| XRCC6 | CTC75 | CTCBF | G22P1 | KU70 | ML8 | TLAA | x射线在中国仓鼠细胞修复补充缺陷修复6 | 亲和力Capture-MS 重新组成复杂 |
BioGRID | 10823961|12519782 |
| ZNF335 | NIF1 | NIF2 | 锌指蛋白335 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12215545 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PID基于“增大化现实”技术的途径 | 61年 | 46 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME发育生物学 | 396年 | 292年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME BMAL1时钟NPAS2激活生理表现 | 36 | 27 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME PPARA激活基因表达 | 104年 | 72年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME RORA基因激活生理表现 | 24 | 17 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME YAP1和WWTR1小胡子刺激基因表达 | 24 | 16 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME昼夜镇压ERBA牧师的表达式 | 23 | 16 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME通用转录途径 | 352年 | 181年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME代谢脂质和脂蛋白 | 478年 | 302年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME脂肪酸三酰甘油和酮体代谢 | 168年 | 115年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME生物钟 | 53 | 40 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME转录调控的白色脂肪细胞的分化 | 72年 | 53 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 刘SOX4 DN的目标 | 309年 | 191年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 林格伦膀胱癌集群3 | 329年 | 196年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PUJANA ATM PCC网络 | 1442年 | 892年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN NUYTTEN NIPP1目标 | 848年 | 527年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 英格拉姆嘘目标了 | 127年 | 79年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布伊泰尔特说光动力治疗压力 | 811年 | 508年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SCHAEFFER前列腺癌发展6小时DN | 514年 | 330年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SCHAEFFER前列腺癌症发展和BOX4 | 11 | 8 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 沈SMARCA2目标了 | 424年 | 268年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 考夫曼DNA复制的基因 | 147年 | 87年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NIKOLSKY乳腺癌20 q11扩增子 | 31日 | 18 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NIKOLSKY突变在乳腺癌和放大 | 94年 | 60 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 快活的HDAC扩散集群DN | 76年 | 57 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 短期伊万诺娃造血干细胞 | 32 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马丁内斯应对TRABECTEDIN DN | 271年 | 175年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACEVEDO肝癌了 | 973年 | 570年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACEVEDO肝脏肿瘤与邻近正常组织 | 863年 | 514年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 结肠癌年级了 | 871年 | 505年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 八木AML和11 q23处重新安排 | 351年 | 238年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN PILON KLF1目标 | 1972年 | 1213年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 棕熊短波紫外线反应早期晚了 | 317年 | 190年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| IKEDA MIR133目标了 | 43 | 27 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-10 | 293年 | 299年 | m8 | hsa-miR-10a | UACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUG |
| hsa-miR-10b | UACCCUGUAGAACCGAAUUUGU | ||||
| mir - 224 | 66年 | 72年 | m8 | hsa - mir - 224 | CAAGUCACUAGUGGUUCCGUUUA |
| miR-23 | 482年 | 489年 | 1、m8 | hsa-miR-23a大脑 | AUCACAUUGCCAGGGAUUUCC |
| hsa-miR-23b大脑 | AUCACAUUGCCAGGGAUUACC | ||||
| mir - 323 | 482年 | 488年 | 1 | hsa - mir - 323大脑 | GCACAUUACACGGUCGACCUCU |
| mir - 369 - 3 - p | 410年 | 416年 | 1 | hsa - mir - 369 - 3 - p | AAUAAUACAUGGUUGAUCUUU |
| mir - 374 | 410年 | 416年 | m8 | hsa - mir - 374 | UUAUAAUACAACCUGAUAAGUG |
| mir - 377 | 347年 | 354年 | 1、m8 | hsa - mir - 377 | AUCACACAAAGGCAACUUUUGU |
| mir - 410 | 412年 | 418年 | 1 | hsa - mir - 410 | AAUAUAACACAGAUGGCCUGU |
| mir - 486 | 291年 | 297年 | m8 | hsa - mir - 486 | UCCUGUACUGAGCUGCCCCGAG |
| mir - 493 - 5 - p | 477年 | 483年 | 1 | hsa - mir - 493 - 5 - p | UUGUACAUGGUAGGCUUUCAUU |