基因页：setd1b

概括？
基因 23067
象征 setd1b
同义词 kmt2g | set1b
描述 设置包含1B的域
参考 MIM：611055|HGNC：HGNC：29187|ENSEMBL：ENSG00000139718|Vega：Otthumg00000169080
基因类型 蛋白质编码
地图位置 12Q24.31
Pascal P值 0.051
Sherlock P值 0.359
胎儿β 1.215
DMG 1（＃研究）
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 染色质重塑基因

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 3

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG16116313 12 122255002 setd1b 4.43e-5 0.256 0.021 DMG：Wockner_2014
CG26419957 12 122222518 setd1b 1.587E-4 0.214 0.032 DMG：Wockner_2014
CG16620766 12 122268197 setd1b 3.834e-4 0.401 0.043 DMG：Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1878839 CHR2 171123122 setd1b 23067 0.15 反式
RS908784 CHR2 171129617 setd1b 23067 0.15 反式
SNP_A-2175755 0 setd1b 23067 0.18 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
UBR3 0.96 0.96
Garnl1 0.95 0.95
ATG2B 0.95 0.94
DMXL1 0.94 0.93
KIAA1128 0.94 0.95
WDR7 0.94 0.94
cltc 0.94 0.93
OPA1 0.94 0.93
AKAP11 0.94 0.94
Btrc 0.93 0.96
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FXYD1 -0.60 -0.64
higd1b -0.60 -0.66
增强 -0.60 -0.70
TLCD1 -0.59 -0.62
AF347015.21 -0.58 -0.63
PLA2G5 -0.58 -0.63
MT-CO2 -0.58 -0.64
EIF4EBP3 -0.58 -0.63
C1orf54 -0.57 -0.69
AF347015.31 -0.57 -0.63

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Kegg赖氨酸降解 44 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 315 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF DN的响应 235 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4 DN的响应 245 150 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 718 401 该途径中的所有SZGR 2.0基因
li诱导了自然杀手DN 116 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因