基因页：CMTR1
概括？
| 基因 | 23070 |
| 象征 | CMTR1 |
| 同义词 | ftsjd2 | kiaa0082 | mtr1 | hmtr1 |
| 描述 | 帽甲基转移酶1 |
| 参考 | MIM：616189|HGNC：HGNC：21077|ENSEMBL：ENSG00000137200|HPRD：08305|Vega：Otthumg0000000014624 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 6p21.2 |
| DEG P值 | DEG：Maycox_2009：CC_BA10_FOLD_CHANGE = -1.11：CC_BA10_DISEASE_P = 0.0398：HBB_BA9_FOLD_CHANGE = -1.15：HBB_BA9_DISEASE_P = 0.0071 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DEG：Maycox_2009 | 微阵列确定验尸后30000多个mRNA转录本的表达 | 我们包括了51个基因，其表达变化在两个精神分裂症队列之间很常见。 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS7739958 | CHR6 | 36954948 | FTSJD2 | 23070 | 0.12 | 顺式 | ||
| RS1570116 | CHR6 | 36957343 | FTSJD2 | 23070 | 0.13 | 顺式 | ||
| RS7743783 | CHR6 | 36958992 | FTSJD2 | 23070 | 0.14 | 顺式 | ||
| RS1753286 | CHR6 | 36970270 | FTSJD2 | 23070 | 0.16 | 顺式 | ||
| RS12677942 | CHR8 | 31539941 | FTSJD2 | 23070 | 0.14 | 反式 | ||
| RS16878286 | CHR8 | 31646175 | FTSJD2 | 23070 | 0.2 | 反式 | ||
| RS16878317 | CHR8 | 31657853 | FTSJD2 | 23070 | 0.13 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| TECPR2 | 0.86 | 0.86 |
| NFE2L1 | 0.85 | 0.85 |
| AGPAT3 | 0.84 | 0.85 |
| TBC1D9B | 0.84 | 0.84 |
| spata2 | 0.83 | 0.85 |
| AP006216.1 | 0.83 | 0.86 |
| ZHX3 | 0.83 | 0.86 |
| sidt2 | 0.82 | 0.81 |
| man2a2 | 0.81 | 0.83 |
| Stat5b | 0.81 | 0.84 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| GNG11 | -0.56 | -0.54 |
| IL32 | -0.54 | -0.54 |
| Sycp3 | -0.52 | -0.53 |
| AL050337.1 | -0.50 | -0.51 |
| AF347015.21 | -0.50 | -0.40 |
| C1orf54 | -0.49 | -0.47 |
| FAM159B | -0.48 | -0.60 |
| CLEC3B | -0.46 | -0.46 |
| clec2b | -0.46 | -0.43 |
| C1orf61 | -0.46 | -0.43 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003676 | 核酸结合 | IEA | - | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005622 | 细胞内 | IEA | - |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-136 | 1175 | 1181 | 1a | HSA-MIR-136 | Acuccauuuuuuugaugaugaugga |
| mir-148/152 | 1186 | 1192 | 1a | HSA-MIR-148A | ucagugcacuacaacuuugu |
| HSA-MIR-152脑 | UCAGUGCAUGACACUUGGG | ||||
| HSA-MIR-148B | ucagugcaucacacaacuuugu | ||||