概括
基因 23072
象征 hecw1
同义词 NEDL1
描述 Hect,C2和WW结构域含有E3泛素蛋白连接酶1
参考 MIM:610384|HGNC:HGNC:22195|HPRD:11385|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7p13
Pascal P值 0.822
胎儿β -0.311
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG02050028 7 43156037 hecw1 1.68e-5 0.63 0.015 DMG:Wockner_2014
CG08039116 7 43152254 hecw1 7.13e-5 -0.401 0.025 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17542055 CHR7 42652803 hecw1 23072 0.18 顺式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
KIAA1109 0.92 0.94
KIAA0232 0.91 0.93
EIF4G3 0.91 0.92
RSC1A1 0.91 0.93
ythdc2 0.91 0.92
ankrd28 0.90 0.91
UBR2 0.90 0.91
MAP3K4 0.90 0.91
C9orf102 0.90 0.93
USP7 0.90 0.90
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.73 -0.70
FXYD1 -0.72 -0.67
higd1b -0.71 -0.71
AF347015.31 -0.71 -0.69
增强 -0.71 -0.77
MT-CO2 -0.71 -0.69
C1orf54 -0.68 -0.74
Metrn -0.68 -0.70
ifi27 -0.68 -0.67
VAMP5 -0.68 -0.69

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Gaussmann MLL AF4融合靶向D 38 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胡血管生成 21 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Firestein增殖 175 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 341 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由PML Rara Fusion绑定的Martens 456 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因