基因页:hecw1
概括?
基因 | 23072 |
象征 | hecw1 |
同义词 | NEDL1 |
描述 | Hect,C2和WW结构域含有E3泛素蛋白连接酶1 |
参考 | MIM:610384|HGNC:HGNC:22195|HPRD:11385| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7p13 |
Pascal P值 | 0.822 |
胎儿β | -0.311 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG02050028 | 7 | 43156037 | hecw1 | 1.68e-5 | 0.63 | 0.015 | DMG:Wockner_2014 |
CG08039116 | 7 | 43152254 | hecw1 | 7.13e-5 | -0.401 | 0.025 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS17542055 | CHR7 | 42652803 | hecw1 | 23072 | 0.18 | 顺式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/HECW1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
KIAA1109 | 0.92 | 0.94 |
KIAA0232 | 0.91 | 0.93 |
EIF4G3 | 0.91 | 0.92 |
RSC1A1 | 0.91 | 0.93 |
ythdc2 | 0.91 | 0.92 |
ankrd28 | 0.90 | 0.91 |
UBR2 | 0.90 | 0.91 |
MAP3K4 | 0.90 | 0.91 |
C9orf102 | 0.90 | 0.93 |
USP7 | 0.90 | 0.90 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.73 | -0.70 |
FXYD1 | -0.72 | -0.67 |
higd1b | -0.71 | -0.71 |
AF347015.31 | -0.71 | -0.69 |
增强 | -0.71 | -0.77 |
MT-CO2 | -0.71 | -0.69 |
C1orf54 | -0.68 | -0.74 |
Metrn | -0.68 | -0.70 |
ifi27 | -0.68 | -0.67 |
VAMP5 | -0.68 | -0.69 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Gaussmann MLL AF4融合靶向D | 38 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
胡血管生成 | 21 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Firestein增殖 | 175 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 | 341 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由PML Rara Fusion绑定的Martens | 456 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |