概括
基因 23080
象征 AVL9
同义词 KIAA0241
描述 AVL9细胞迁移相关
参考 MIM:612927|HGNC:HGNC:28994|Ensembl:ENSG00000105778|HPRD:13788|Vega:Otthumg00000152929
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7p14.3
Pascal P值 0.063
胎儿β -0.448
DMG 1(#研究)
主持人

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG24077501 7 32996869 AVL9 1.26E-9 -0.015 1.32E-6 DMG:JAFFE_2016
CG20743544 7 32982957 AVL9 4.09e-9 -0.024 2.49E-6 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C1orf58 0.88 0.90
KIAA0196 0.86 0.88
MON2 0.86 0.88
FRS2 0.86 0.89
IPO8 0.85 0.87
setx 0.85 0.88
FNIP1 0.85 0.87
炸弹 0.84 0.87
LARP4 0.84 0.87
0.84 0.86
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
IL32 -0.57 -0.59
CXCL14 -0.56 -0.60
ifi27 -0.55 -0.60
AF347015.21 -0.54 -0.54
MT-CO2 -0.53 -0.56
增强 -0.53 -0.63
CSAG1 -0.53 -0.53
FXYD1 -0.52 -0.56
higd1b -0.52 -0.57
C16orf14 -0.51 -0.62

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
乳腺癌腔与基础 380 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
hahtola兄弟姐妹fungoides CD4 DN 116 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向G 238 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房5 6WK 116 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 XPCS DN 88 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 TTD DN 84 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath增殖 147 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
flt3的大风apl突变 56 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TACI DN的Moreaux多发性骨髓瘤 172 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kondo EZH2目标 245 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mitsiades对aplidin DN的反应 249 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chen Hoxa5靶向9小时 223 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤 207 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染4小时DN 254 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Changolkar H2AFY目标 48 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因