基因页:AVL9
概括?
基因 | 23080 |
象征 | AVL9 |
同义词 | KIAA0241 |
描述 | AVL9细胞迁移相关 |
参考 | MIM:612927|HGNC:HGNC:28994|Ensembl:ENSG00000105778|HPRD:13788|Vega:Otthumg00000152929 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7p14.3 |
Pascal P值 | 0.063 |
胎儿β | -0.448 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG24077501 | 7 | 32996869 | AVL9 | 1.26E-9 | -0.015 | 1.32E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
CG20743544 | 7 | 32982957 | AVL9 | 4.09e-9 | -0.024 | 2.49E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/AVL9_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C1orf58 | 0.88 | 0.90 |
KIAA0196 | 0.86 | 0.88 |
MON2 | 0.86 | 0.88 |
FRS2 | 0.86 | 0.89 |
IPO8 | 0.85 | 0.87 |
setx | 0.85 | 0.88 |
FNIP1 | 0.85 | 0.87 |
炸弹 | 0.84 | 0.87 |
LARP4 | 0.84 | 0.87 |
痒 | 0.84 | 0.86 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
IL32 | -0.57 | -0.59 |
CXCL14 | -0.56 | -0.60 |
ifi27 | -0.55 | -0.60 |
AF347015.21 | -0.54 | -0.54 |
MT-CO2 | -0.53 | -0.56 |
增强 | -0.53 | -0.63 |
CSAG1 | -0.53 | -0.53 |
FXYD1 | -0.52 | -0.56 |
higd1b | -0.52 | -0.57 |
C16orf14 | -0.51 | -0.62 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
乳腺癌腔与基础 | 380 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
hahtola兄弟姐妹fungoides CD4 DN | 116 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶向G | 238 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房5 6WK | 116 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 XPCS DN | 88 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 TTD DN | 84 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath增殖 | 147 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
flt3的大风apl突变 | 56 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TACI DN的Moreaux多发性骨髓瘤 | 172 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kondo EZH2目标 | 245 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mitsiades对aplidin DN的反应 | 249 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chen Hoxa5靶向9小时 | 223 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤 | 207 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染4小时DN | 254 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Changolkar H2AFY目标 | 48 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |