基因页面:KDM4C
总结吗?
GeneID | 23081年 |
象征 | KDM4C |
同义词 | GASC1 | JHDM3C | JMJD2C | TDRD14C |
描述 | 赖氨酸demethylase 4摄氏度 |
参考 | MIM: 605469|HGNC: HGNC: 17071|运用:ENSG00000107077|运用:ENSG00000274527|运用:ENSG00000282960|HPRD: 12016|织女:OTTHUMG00000019536织女:OTTHUMG00000187508 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 9 p24.1 |
帕斯卡假定值 | 1.313的军医 |
胎儿β | -0.567 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 小脑半球 小脑 |
支持 | 染色质重塑基因 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:GWAScat | 全基因组关联研究 | 这个数据集包含560个snp与精神分裂症有关。总共有486个基因映射到这些snp在50 kb。 | |
简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg14473811 | 9 | 6757912 | KDM4C | 2.73 e-9 | -0.009 | 1.95 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/KDM4C_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
TGFBRAP1 | 0.96 | 0.97 |
ZNF398 | 0.96 | 0.96 |
URB1 | 0.96 | 0.97 |
DIP2C | 0.96 | 0.96 |
FOXK2 | 0.95 | 0.96 |
SEC16A | 0.95 | 0.96 |
ZNF317 | 0.95 | 0.96 |
MTMR4 | 0.95 | 0.97 |
LDOC1L | 0.95 | 0.97 |
SEC24C | 0.95 | 0.96 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.76 | -0.88 |
MT-CO2 | -0.75 | -0.88 |
AF347015.27 | -0.73 | -0.85 |
FXYD1 | -0.73 | -0.84 |
AF347015.33 | -0.72 | -0.82 |
MT-CYB | -0.72 | -0.83 |
AF347015.8 | -0.72 | -0.86 |
HIGD1B | -0.72 | -0.85 |
S100B | -0.71 | -0.81 |
IFI27 | -0.70 | -0.81 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
PID基于“增大化现实”技术的途径 | 61年 | 46 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DAVICIONI分子武器VS erm | 332年 | 228年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
罗德里格斯NTN1 DN的目标 | 158年 | 102年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PROVENZANI转移了 | 194年 | 112年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SNIJDERS放大在头部和颈部肿瘤 | 37 | 27 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
通过ERCC3 DN滑落紫外线反应 | 855年 | 609年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NUYTTEN NIPP1的目标了 | 769年 | 437年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NUYTTEN EZH2的目标了 | 1037年 | 673年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
公园HSC VS多能祖细胞DN | 18 | 12 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MENSE缺氧了 | 98年 | 71年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
苏唾腺 | 16 | 9 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
崔TCF21目标2 DN | 830年 | 547年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
布朗感染48小时血巨细胞病毒 | 180年 | 125年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
布朗感染血巨细胞病毒18人力资源 | 178年 | 111年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |