概括
基因 23082
象征 PPRC1
同义词 中国
描述 过氧化物酶体增殖物激活受体伽马,共激活因子相关1
参考 HGNC:HGNC:30025|ENSEMBL:ENSG00000148840|HPRD:15173|Vega:Otthumg0000000018948
基因类型 蛋白质编码
地图位置 10q24.32
Pascal P值 4.589E-4
Sherlock P值 0.122
胎儿β 0.34
DMG 2(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Vaneijk_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 2
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG07310536 10 103892743 PPRC1 3.15e-5 -0.497 0.019 DMG:Wockner_2014
CG18390025 10 103986736 PPRC1 0.001 2.194 DMG:Vaneijk_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS7892835 Chrx 20184036 PPRC1 23082 0.16 反式
RS4129871 Chrx 20225192 PPRC1 23082 0.18 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CPSF6 0.96 0.97
SP4 0.96 0.96
WHSC1L1 0.95 0.97
GTF3C4 0.95 0.97
NUP153 0.95 0.96
ZNF518B 0.95 0.96
TCEB3 0.95 0.95
CNOT6 0.95 0.94
DDX6 0.95 0.94
PBRM1 0.94 0.95
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AIFM3 -0.75 -0.82
FXYD1 -0.74 -0.91
AF347015.31 -0.74 -0.89
S100B -0.74 -0.87
MT-CO2 -0.73 -0.91
TSC22D4 -0.73 -0.83
HLA-F -0.72 -0.79
AF347015.33 -0.72 -0.87
C5orf53 -0.72 -0.77
hepn1 -0.72 -0.79

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Ginestier乳腺癌Znf217扩增DN 335 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nagashima NRG1信号向上发出 176 123 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
berenjeno由Rhoa Up Troment 536 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser MYC靶标和血清反应 47 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过ELK3 UP总缺氧 209 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过HIF1A的总缺氧 77 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过ELK3和HIF1A的总缺氧 142 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血早期祖先 532 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dazard对UV NHEK DN的反应 318 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
被胰岛素抵抗钝化的sartipy 19 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向DN 292 189 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 281 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
mir15a和mir16 1的Bonci目标 91 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Karlsson TGFB1靶向 127 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的 211 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 281 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
杨Bcl3靶向 364 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因