基因页:PPRC1
概括?
基因 | 23082 |
象征 | PPRC1 |
同义词 | 中国 |
描述 | 过氧化物酶体增殖物激活受体伽马,共激活因子相关1 |
参考 | HGNC:HGNC:30025|ENSEMBL:ENSG00000148840|HPRD:15173|Vega:Otthumg0000000018948 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 10q24.32 |
Pascal P值 | 4.589E-4 |
Sherlock P值 | 0.122 |
胎儿β | 0.34 |
DMG | 2(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Vaneijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 | 2 |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG07310536 | 10 | 103892743 | PPRC1 | 3.15e-5 | -0.497 | 0.019 | DMG:Wockner_2014 |
CG18390025 | 10 | 103986736 | PPRC1 | 0.001 | 2.194 | DMG:Vaneijk_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS7892835 | Chrx | 20184036 | PPRC1 | 23082 | 0.16 | 反式 | ||
RS4129871 | Chrx | 20225192 | PPRC1 | 23082 | 0.18 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PPRC1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
CPSF6 | 0.96 | 0.97 |
SP4 | 0.96 | 0.96 |
WHSC1L1 | 0.95 | 0.97 |
GTF3C4 | 0.95 | 0.97 |
NUP153 | 0.95 | 0.96 |
ZNF518B | 0.95 | 0.96 |
TCEB3 | 0.95 | 0.95 |
CNOT6 | 0.95 | 0.94 |
DDX6 | 0.95 | 0.94 |
PBRM1 | 0.94 | 0.95 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AIFM3 | -0.75 | -0.82 |
FXYD1 | -0.74 | -0.91 |
AF347015.31 | -0.74 | -0.89 |
S100B | -0.74 | -0.87 |
MT-CO2 | -0.73 | -0.91 |
TSC22D4 | -0.73 | -0.83 |
HLA-F | -0.72 | -0.79 |
AF347015.33 | -0.72 | -0.87 |
C5orf53 | -0.72 | -0.77 |
hepn1 | -0.72 | -0.79 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Ginestier乳腺癌Znf217扩增DN | 335 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nagashima NRG1信号向上发出 | 176 | 123 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
berenjeno由Rhoa Up Troment | 536 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser MYC靶标和血清反应 | 47 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过ELK3 UP总缺氧 | 209 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过HIF1A的总缺氧 | 77 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过ELK3和HIF1A的总缺氧 | 142 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血早期祖先 | 532 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dazard对UV NHEK DN的反应 | 318 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
被胰岛素抵抗钝化的sartipy | 19 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向DN | 292 | 189 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 | 281 | 179 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
mir15a和mir16 1的Bonci目标 | 91 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Karlsson TGFB1靶向 | 127 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的 | 211 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 | 281 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
杨Bcl3靶向 | 364 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |