基因页:exph5
概括?
基因 | 23086 |
象征 | exph5 |
同义词 | slac2-b | slac2b |
描述 | 卵蛋白5 |
参考 | MIM:612878|HGNC:HGNC:30578|ENSEMBL:ENSG00000110723|HPRD:08341|Vega:Otthumg00000166536 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11q22.3 |
Pascal P值 | 0.079 |
胎儿β | -1.393 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.006 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG16988008 | 11 | 108463728 | exph5 | 2.341E-4 | -0.161 | 0.037 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS17572651 | CHR1 | 218943612 | exph5 | 23086 | 0 | 反式 | ||
RS16829545 | CHR2 | 151977407 | exph5 | 23086 | 8.41E-23 | 反式 | ||
RS3845734 | CHR2 | 171125572 | exph5 | 23086 | 0.01 | 反式 | ||
RS7584986 | CHR2 | 184111432 | exph5 | 23086 | 5.761E-10 | 反式 | ||
RS9810143 | CHR3 | 5060209 | exph5 | 23086 | 0.03 | 反式 | ||
RS16860529 | CHR3 | 185900368 | exph5 | 23086 | 0.18 | 反式 | ||
RS363082 | CHR4 | 3132712 | exph5 | 23086 | 0.09 | 反式 | ||
SNP_A-1815771 | 0 | exph5 | 23086 | 0.04 | 反式 | |||
RS335980 | CHR4 | 173329784 | exph5 | 23086 | 0.16 | 反式 | ||
RS17762315 | CHR5 | 76807576 | exph5 | 23086 | 0.16 | 反式 | ||
RS10491487 | CHR5 | 80323367 | exph5 | 23086 | 0.2 | 反式 | ||
RS11738579 | CHR5 | 95119841 | exph5 | 23086 | 0.14 | 反式 | ||
RS13360496 | 0 | exph5 | 23086 | 0.15 | 反式 | |||
RS13191953 | CHR6 | 24151042 | exph5 | 23086 | 0.11 | 反式 | ||
RS12196880 | CHR6 | 24313746 | exph5 | 23086 | 0.05 | 反式 | ||
RS10806988 | CHR6 | 24341768 | exph5 | 23086 | 0.11 | 反式 | ||
RS16890367 | CHR6 | 38078448 | exph5 | 23086 | 0.05 | 反式 | ||
RS1929769 | CHR6 | 40765977 | exph5 | 23086 | 0.15 | 反式 | ||
RS3118341 | Chr9 | 25185518 | exph5 | 23086 | 0.07 | 反式 | ||
RS9406868 | Chr9 | 25223372 | exph5 | 23086 | 0.09 | 反式 | ||
RS11139334 | Chr9 | 84209393 | exph5 | 23086 | 4.214E-4 | 反式 | ||
RS3765543 | Chr9 | 134458323 | exph5 | 23086 | 0.05 | 反式 | ||
RS2393316 | Chr10 | 59333070 | exph5 | 23086 | 0 | 反式 | ||
RS9989228 | CHR14 | 37809252 | exph5 | 23086 | 0.19 | 反式 | ||
RS16955618 | CHR15 | 29937543 | exph5 | 23086 | 5.848e-34 | 反式 | ||
RS2077735 | CHR15 | 58479024 | exph5 | 23086 | 0.09 | 反式 | ||
RS12914345 | CHR15 | 77670400 | exph5 | 23086 | 0.19 | 反式 | ||
RS11873184 | CHR18 | 1584081 | exph5 | 23086 | 0.05 | 反式 | ||
RS17761686 | CHR18 | 56647634 | exph5 | 23086 | 0.09 | 反式 | ||
RS7274477 | CHR20 | 1676942 | exph5 | 23086 | 0.08 | 反式 | ||
RS1041786 | CHR21 | 22617710 | exph5 | 23086 | 5.048e-5 | 反式 | ||
RS16990575 | Chrx | 32691327 | exph5 | 23086 | 0.17 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/EXPH5_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SRGAP1 | 0.94 | 0.92 |
ZBED4 | 0.93 | 0.96 |
NHSL1 | 0.93 | 0.85 |
IL17RD | 0.93 | 0.94 |
ZNF462 | 0.92 | 0.94 |
asxl3 | 0.92 | 0.91 |
FRMD4B | 0.92 | 0.84 |
bend3 | 0.92 | 0.93 |
myst4 | 0.92 | 0.96 |
bcl7a | 0.92 | 0.93 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FBXO2 | -0.66 | -0.68 |
LHPP | -0.65 | -0.59 |
AIFM3 | -0.65 | -0.76 |
C5orf53 | -0.65 | -0.79 |
HLA-F | -0.65 | -0.76 |
aldoc | -0.65 | -0.72 |
ACOT13 | -0.64 | -0.76 |
LDHD | -0.64 | -0.67 |
TSC22D4 | -0.63 | -0.78 |
克鲁 | -0.63 | -0.68 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
GO:0017137 | Rab GTPase结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006886 | 细胞内蛋白转运 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PAX FOXO1融合DN的Davicioni目标DN | 68 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与间充质 | 450 | 256 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jaeger转移DN | 258 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
UDayakumar Med1靶向 | 135 | 82 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
冷吉非替尼抵抗DN | 230 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
瓦特自动甲状腺腺瘤 | 73 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向DN | 848 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ferreira Ewings肉瘤不稳定与稳定DN | 98 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标2 DN | 464 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn | 546 | 351 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 | 412 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染16小时 | 225 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dazard对UV NHEK DN的反应 | 318 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
贝尔德糖尿病性肾病DN | 434 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dazard UV响应集群G6 | 153 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lein Cerebellum标记 | 85 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bochkis foxa2目标 | 425 | 261 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bohn原发性免疫缺陷综合症 | 47 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boyault肝癌子类G123 DN | 51 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌子类CTNNB1 UP | 176 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌亚类干扰素DN | 52 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML带有Inv 16易位 | 422 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF ICP与H3K27Me3 | 206 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fournier腺泡开发2 | 277 | 172 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Acosta增殖独立MYC靶向 | 84 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |