概括
基因 23086
象征 exph5
同义词 slac2-b | slac2b
描述 卵蛋白5
参考 MIM:612878|HGNC:HGNC:30578|ENSEMBL:ENSG00000110723|HPRD:08341|Vega:Otthumg00000166536
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11q22.3
Pascal P值 0.079
胎儿β -1.393
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.006

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG16988008 11 108463728 exph5 2.341E-4 -0.161 0.037 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17572651 CHR1 218943612 exph5 23086 0 反式
RS16829545 CHR2 151977407 exph5 23086 8.41E-23 反式
RS3845734 CHR2 171125572 exph5 23086 0.01 反式
RS7584986 CHR2 184111432 exph5 23086 5.761E-10 反式
RS9810143 CHR3 5060209 exph5 23086 0.03 反式
RS16860529 CHR3 185900368 exph5 23086 0.18 反式
RS363082 CHR4 3132712 exph5 23086 0.09 反式
SNP_A-1815771 0 exph5 23086 0.04 反式
RS335980 CHR4 173329784 exph5 23086 0.16 反式
RS17762315 CHR5 76807576 exph5 23086 0.16 反式
RS10491487 CHR5 80323367 exph5 23086 0.2 反式
RS11738579 CHR5 95119841 exph5 23086 0.14 反式
RS13360496 0 exph5 23086 0.15 反式
RS13191953 CHR6 24151042 exph5 23086 0.11 反式
RS12196880 CHR6 24313746 exph5 23086 0.05 反式
RS10806988 CHR6 24341768 exph5 23086 0.11 反式
RS16890367 CHR6 38078448 exph5 23086 0.05 反式
RS1929769 CHR6 40765977 exph5 23086 0.15 反式
RS3118341 Chr9 25185518 exph5 23086 0.07 反式
RS9406868 Chr9 25223372 exph5 23086 0.09 反式
RS11139334 Chr9 84209393 exph5 23086 4.214E-4 反式
RS3765543 Chr9 134458323 exph5 23086 0.05 反式
RS2393316 Chr10 59333070 exph5 23086 0 反式
RS9989228 CHR14 37809252 exph5 23086 0.19 反式
RS16955618 CHR15 29937543 exph5 23086 5.848e-34 反式
RS2077735 CHR15 58479024 exph5 23086 0.09 反式
RS12914345 CHR15 77670400 exph5 23086 0.19 反式
RS11873184 CHR18 1584081 exph5 23086 0.05 反式
RS17761686 CHR18 56647634 exph5 23086 0.09 反式
RS7274477 CHR20 1676942 exph5 23086 0.08 反式
RS1041786 CHR21 22617710 exph5 23086 5.048e-5 反式
RS16990575 Chrx 32691327 exph5 23086 0.17 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SRGAP1 0.94 0.92
ZBED4 0.93 0.96
NHSL1 0.93 0.85
IL17RD 0.93 0.94
ZNF462 0.92 0.94
asxl3 0.92 0.91
FRMD4B 0.92 0.84
bend3 0.92 0.93
myst4 0.92 0.96
bcl7a 0.92 0.93
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FBXO2 -0.66 -0.68
LHPP -0.65 -0.59
AIFM3 -0.65 -0.76
C5orf53 -0.65 -0.79
HLA-F -0.65 -0.76
aldoc -0.65 -0.72
ACOT13 -0.64 -0.76
LDHD -0.64 -0.67
TSC22D4 -0.63 -0.78
克鲁 -0.63 -0.68

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
GO:0017137 Rab GTPase结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006886 细胞内蛋白转运 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PAX FOXO1融合DN的Davicioni目标DN 68 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质 450 256 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jaeger转移DN 258 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UDayakumar Med1靶向 135 82 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
冷吉非替尼抵抗DN 230 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
瓦特自动甲状腺腺瘤 73 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ferreira Ewings肉瘤不稳定与稳定DN 98 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath SOX2目标 734 436 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2 DN 464 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 412 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染16小时 225 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dazard对UV NHEK DN的反应 318 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
贝尔德糖尿病性肾病DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard UV响应集群G6 153 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein Cerebellum标记 85 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bochkis foxa2目标 425 261 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bohn原发性免疫缺陷综合症 47 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G123 DN 51 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌子类CTNNB1 UP 176 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类干扰素DN 52 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带有Inv 16易位 422 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF ICP与H3K27Me3 206 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fournier腺泡开发2 277 172 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Acosta增殖独立MYC靶向 84 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因