基因页:iqsec2
概括?
基因 | 23096 |
象征 | iqsec2 |
同义词 | brag1 | mrx1 |
描述 | 智商主题和SEC7域2 |
参考 | MIM:300522|HGNC:HGNC:29059|ENSEMBL:ENSG00000124313|HPRD:10012|Vega:Otthumg0000000021608 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | XP11.22 |
胎儿β | -0.278 |
支持 | 细胞内信号转导 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS G2CDB.HUMAN_TAP-PSD-95核 g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP COMPOSITESET Darnell FMRP目标 潜在的突触基因 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/IQSEC2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
tgoln2 | 0.93 | 0.94 |
ATG2B | 0.93 | 0.94 |
USP32 | 0.91 | 0.91 |
ENTPD4 | 0.91 | 0.92 |
VPS13D | 0.91 | 0.92 |
BTBD9 | 0.91 | 0.91 |
trappc10 | 0.91 | 0.92 |
plekhm3 | 0.91 | 0.92 |
phlpp2 | 0.91 | 0.92 |
DMXL2 | 0.91 | 0.91 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.60 | -0.56 |
C1orf54 | -0.57 | -0.63 |
higd1b | -0.56 | -0.56 |
C1orf61 | -0.55 | -0.66 |
AF347015.31 | -0.55 | -0.52 |
GNG11 | -0.55 | -0.56 |
DBI | -0.55 | -0.61 |
MT-CO2 | -0.55 | -0.53 |
C16orf74 | -0.54 | -0.58 |
IL32 | -0.54 | -0.52 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG内吞作用 | 183 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
中村肿瘤区周围与中央DN | 634 | 384 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim WT1靶向DN | 459 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
促进耐受巨噬细胞 | 156 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MCV6 LCP带有H3K4Me3 | 162 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF LCP带有H3K4ME3 | 128 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染1小时DN | 222 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |