基因页面:TBC1D2B
总结吗?
| GeneID | 23102年 |
| 象征 | TBC1D2B |
| 同义词 | - - - - - - |
| 描述 | TBC1域家庭成员2 b |
| 参考 | HGNC: HGNC: 29183|运用:ENSG00000167202|HPRD: 08310|织女:OTTHUMG00000152885 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 15 q24.3-q25.1 |
| 帕斯卡假定值 | 0.574 |
| 夏洛克假定值 | 0.123 |
| 胎儿β | 0.177 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg06786153 | 15 | 78327011 | TBC1D2B | 4.922的军医 | 0.5 | 0.047 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs16829545 | chr2 | 151977407 | TBC1D2B | 23102年 | 0.12 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ZNF518B | 0.97 | 0.97 |
| PAK2 | 0.97 | 0.97 |
| LATS1 | 0.97 | 0.97 |
| BCLAF1 | 0.96 | 0.96 |
| PDS5A | 0.96 | 0.97 |
| CHD9 | 0.96 | 0.97 |
| ZNF292 | 0.96 | 0.97 |
| IREB2 | 0.96 | 0.96 |
| C1orf9 | 0.96 | 0.97 |
| 叫做PBRM1 | 0.96 | 0.97 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.72 | -0.86 |
| FXYD1 | -0.72 | -0.86 |
| MT-CO2 | -0.71 | -0.87 |
| HLA-F | -0.70 | -0.75 |
| AF347015.27 | -0.70 | -0.83 |
| IFI27 | -0.70 | -0.85 |
| AF347015.33 | -0.70 | -0.83 |
| C5orf53 | -0.70 | -0.73 |
| AIFM3 | -0.69 | -0.73 |
| S100B | -0.69 | -0.79 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 林格伦膀胱癌集群3 DN | 229年 | 142年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 障碍癌症复发正常样本DN | 31日 | 19 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 胎儿肝脏DN MARTORIATI MDM4目标 | 514年 | 319年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布伊泰尔特说光动力治疗压力DN | 637年 | 377年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 彭亮氨酸剥夺DN | 187年 | 122年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 与17个p13 HASLINGER B CLL删除 | 21 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RODWELL肾脏老化了 | 487年 | 303年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DEBIASI由呼肠孤病毒感染细胞凋亡DN | 287年 | 208年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 西方肾上腺皮质肿瘤DN | 546年 | 362年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 开罗肝母细胞癌类DN | 210年 | 141年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN KARLSSON TGFB1目标 | 207年 | 139年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN PILON KLF1目标 | 1972年 | 1213年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由1日EGF ZWANG瞬变脉冲 | 1839年 | 928年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ZWANG EGF间隔DN | 214年 | 124年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |