基因页：TNRC6B
概括？
| 基因 | 23112 |
| 象征 | TNRC6B |
| 同义词 | - |
| 描述 | 含6B的三核苷酸重复 |
| 参考 | MIM：610740|HGNC：HGNC：29190|ENSEMBL：ENSG00000100354|Vega：Otthumg00000151114 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 22q13.1 |
| Pascal P值 | 0.028 |
| Sherlock P值 | 0.763 |
| 胎儿β | 0.411 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG08758916 | 22 | 40440666 | TNRC6B | 9.19e-8 | -0.845 | 0.003 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS16829545 | CHR2 | 151977407 | TNRC6B | 23112 | 0.03 | 反式 | ||
| RS3106445 | CHR3 | 165326464 | TNRC6B | 23112 | 0.2 | 反式 | ||
| RS1199915 | 0 | TNRC6B | 23112 | 0.17 | 反式 | |||
| RS520325 | CHR3 | 165361016 | TNRC6B | 23112 | 0.08 | 反式 | ||
| RS1020772 | Chr9 | 76532511 | TNRC6B | 23112 | 0.11 | 反式 | ||
| RS10891790 | Chr11 | 114856009 | TNRC6B | 23112 | 0.14 | 反式 | ||
| RS3217906 | CHR12 | 4405803 | TNRC6B | 23112 | 0.18 | 反式 | ||
| RS16955618 | CHR15 | 29937543 | TNRC6B | 23112 | 0.02 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| man2a2 | 0.86 | 0.86 |
| 阿拉德 | 0.82 | 0.81 |
| Stat5b | 0.79 | 0.81 |
| WDR42A | 0.79 | 0.77 |
| KLHL21 | 0.79 | 0.74 |
| ABCC5 | 0.78 | 0.77 |
| Plekha2 | 0.77 | 0.75 |
| NCKIPSD | 0.77 | 0.81 |
| PTPDC1 | 0.77 | 0.79 |
| PXK | 0.77 | 0.78 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| CLEC3B | -0.46 | -0.54 |
| IL32 | -0.46 | -0.49 |
| RP9P | -0.43 | -0.48 |
| FAM159B | -0.42 | -0.57 |
| Spink8 | -0.42 | -0.46 |
| AF347015.21 | -0.41 | -0.28 |
| GNG11 | -0.41 | -0.38 |
| BTBD17 | -0.40 | -0.45 |
| RP11-3P17.1 | -0.39 | -0.48 |
| DBI | -0.39 | -0.41 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Reactome PreNCH的转录和翻译 | 29 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Pre Notch表达和处理 | 44 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组调节RNA途径 | 26 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Notch的Reactome信号传导 | 103 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 渡边直肠癌放疗反应能力 | 108 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Liu Sox4靶向DN | 309 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 奥斯曼膀胱癌 | 404 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 FLII融合DN的Kinsey目标 | 329 | 219 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN | 805 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schlosser血清反应 | 134 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten Nipp1靶向 | 769 | 437 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发6小时DN | 514 | 330 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发和癌症Box4 DN | 32 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 彭葡萄糖剥夺DN | 169 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血成熟细胞 | 293 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bild HRAS致癌特征 | 261 | 166 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat的反应24小时 | 783 | 442 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zheng由Foxp3绑定 | 491 | 310 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kondo EZH2目标 | 245 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kyng Werner综合征和正常老化DN | 225 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Karlsson TGFB1靶向DN | 207 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gabriely miR21靶标 | 289 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 双龙血清敏感基因 | 90 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bilanges血清反应翻译 | 37 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SPI1和FLI1的Juban目标 | 115 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |