基因页：NFASC

概括？
基因 23114
象征 NFASC
同义词 nf | nrcaml
描述 神经fescin
参考 MIM：609145|HGNC：HGNC：29866|ENSEMBL：ENSG00000163531|HPRD：12372|Vega：Otthumg00000151697
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1q32.1
TADA P值 0.023
胎儿β -0.27
DMG 1（＃研究）
支持 细胞粘附和透射信号传导
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS
COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV：GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 1
DNM：Fromer_2014 整个外显子组测序分析 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究，该研究使用基因组DNA报告了DNM。
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献：0.0024

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 筛 CG46 特征 学习
NFASC CHR1 204942490 t C NM_001005388
NM_001005389
NM_001160331
NM_001160332
NM_001160333
NM_015090		 p.408c> r
p.408c> r
p.419c> r
p.419c> r
p.402c> r
p.419c> r		 错过
错过
错过
错过
错过
错过		 精神分裂症 DNM：Fromer_2014

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG24085946 1 204797839 NFASC 3.809E-4 -0.161 0.043 DMG：Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
GPR176 0.77 0.81
EVI5L 0.77 0.78
AC132186.2 0.77 0.81
GPR68 0.75 0.83
SYT3 0.75 0.81
CNRIP1 0.75 0.78
myo16 0.75 0.74
gnaz 0.74 0.73
SESN2 0.74 0.76
traf5 0.73 0.77
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.50 -0.44
AF347015.2 -0.50 -0.43
MT-CO2 -0.50 -0.42
AF347015.31 -0.49 -0.42
AF347015.8 -0.48 -0.41
GNG11 -0.47 -0.51
AF347015.33 -0.47 -0.38
mt-cyb -0.46 -0.38
AC098691.2 -0.46 -0.49
AP002478.3 -0.46 -0.47

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005515 蛋白质结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007155 细胞粘附 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0016021 膜不可或缺 IEA -
去：0005886 质膜 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
kegg细胞粘附分子凸轮 134 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX FOXO1融合的Davicioni目标 255 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向DN 536 332 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee神经Crest干细胞向上 146 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肺癌吸烟者 80 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cheok对伏硫嘌呤DN的反应 22 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿斯顿主要抑郁症DN 160 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马纳洛缺氧 207 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindvall因TERT DN永生 80 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染48小时DN 504 323 该途径中的所有SZGR 2.0基因
贝尔德糖尿病性肾病DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
华莱士前列腺癌竞赛 299 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rattenbacher由Celf1绑定 467 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-10 2039 2046 1A，M8 HSA-MIR-10A uacccuguagauccgaauuugug
HSA-MIR-10B uacccuguagaaccgaauuugu
mir-124.1 1331 1337 M8 HSA-MIR-124A UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir-124/506 1331 1337 1a HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-128 5355 5361 1a HSA-MIR-128A ucacagugaaccggucuuuu
HSA-MIR-128B ucacagugaaccggucuuc
mir-137 5561 5568 1A，M8 HSA-MIR-137 uauugcuuaagaauacgcguag
mir-141/200a 5697 5703 M8 HSA-MIR-141 uaacacugucugugugugugaugg
HSA-MIR-200A uaacacugucuguguguguaaacgaugu
mir-150 5581 5587 1a HSA-MIR-150 ucucccaacccuuguaccagug
mir-182 5730 5736 M8 HSA-MIR-182 uuuggcaaugguagaacucaca
mir-190 1252 1259 1A，M8 HSA-MIR-190 ugauuauguuugauauauauaggu
MiR-200BC/429 4860 4866 1a HSA-MIR-200B uaauacugccugguaaugaugac
HSA-MIR-200C uaauacugccggguaaugaugg
HSA-MIR-429 uaauacuguguguguguguaaaaaccgu
mir-27 5355 5362 1A，M8 HSA-MIR-27A脑 uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27B脑 uucacaguggcuaaguucugc
mir-329 1095 1101 M8 HSA-MIR-329脑 aacacaccugguaaccucuuu
mir-339 2038 2044 M8 HSA-MIR-339 ucccuccuccaggagcuca
mir-370 6110 6116 M8 HSA-MIR-370脑 gccugggggguggaaccugg
mir-381 6238 6244 1a HSA-MIR-381 uauacaagggcaagcucucugu
mir-9 1578年 1584年 M8 HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga