基因页：CLASP2

Summary？
基因 23122
象征 CLASP2
同义词 -
描述 细胞质接头相关蛋白2
参考 MIM：605853|HGNC：HGNC：17078|ENSEMBL：ENSG00000163539|HPRD：12054|Vega：Otthumg00000156489
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3P22.3
Pascal P值 0.01
Sherlock p-value 0.525
主持人 Myers' cis & trans
支持 结构可塑性
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS
CompositeSet
Darnell FMRP目标

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_I Genome scan meta-analysis Psr: 0.006
网络 Shortest path distance of core genes in the Human protein-protein interaction network PPI网络中最短路径的贡献：0.0261

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS736718 CHR16 82656424 CLASP2 23122 0.19 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
mtor 0.94 0.95
myh10 0.92 0.93
CLCN6 0.92 0.92
UBE2O 0.92 0.93
LARP4B 0.92 0.92
EIF4G3 0.91 0.92
HERC2 0.91 0.92
VPS53 0.91 0.91
Atrn 0.91 0.93
ADAR 0.91 0.92
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.71 -0.70
higd1b -0.70 -0.72
AF347015.21 -0.69 -0.73
C1orf54 -0.69 -0.79
MT-CO2 -0.68 -0.68
FXYD1 -0.68 -0.66
GNG11 -0.66 -0.70
VAMP5 -0.66 -0.68
AC021016.1 -0.65 -0.65
S100A16 -0.65 -0.66

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005515 蛋白质结合 IEA -
去：0005515 蛋白质结合 IPI 11290329
去：0008107 半乳糖苷2-α-L-L-核糖基转移酶活性 nas 11290329
去：0008017 微管结合 IEA -
GO：0051010 微管加末端结合 艾达 11290329
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007026 微管解聚的负调节 IEA -
去：0007026 微管解聚的负调节 nas 11290329
去：0007163 细胞极性的建立或维护 TAS 15928712
去：0007049 细胞周期 IEA -
去：0007067 mitosis IEA -
去：0051301 细胞分裂 IEA -
去：0031110 微管聚合或解聚的调节 IMP 11290329
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0000777 凝结的染色体动力学 IEA -
去：0005794 高尔基体 艾达 11290329
去：0005794 高尔基体 IEA -
GO:0005813 中心体 IEA -
GO:0005819 主轴 IEA -
GO:0005828 动力学微管 TAS 12837247
去：0005856 细胞骨架 IEA -
去：0005881 细胞质微管 艾达 11290329
去：0005881 细胞质微管 IEA -
去：0005737 cytoplasm nas 11290329

Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Davicioni分子臂与ERMS 332 228 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mullighan MLL签名2 UP 418 263 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781 1082 All SZGR 2.0 genes in this pathway
EWS FLI1融合DN的Siligan目标 18 9 All SZGR 2.0 genes in this pathway
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Schlosser血清反应DN 712 443 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN 483 336 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 All SZGR 2.0 genes in this pathway
金正日生发中心辅助T DN 24 15 All SZGR 2.0 genes in this pathway
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 All SZGR 2.0 genes in this pathway
罗德韦尔衰老肾脏无血DN 150 93 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Sansom APC目标 212 121 All SZGR 2.0 genes in this pathway
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boylan多发性骨髓瘤C D 139 95 All SZGR 2.0 genes in this pathway
罗斯白血病与MLL融合 78 49 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YAGI AML WITH T 9 11 TRANSLOCATION 130 87 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kim所有疾病持续时间corr dn 146 90 All SZGR 2.0 genes in this pathway
verhaak胶质母细胞瘤pro 177 132 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pilon KLF1靶向 504 321 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 miRNA ID mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
Let-7/98 1078 1084 M8 海关a-let-7a脑 ugagguaguaguauauaguu
海关a-let-7b脑 ugagguaguagguuguguguguu
海关a-let-7c脑 ugagguaguagguuguaugguu
海关a-let-7d脑 AGAGGUAGUAGGUUGCAUAGU
海关a-let-7e脑 ugagguaggagguuauauagu
海关a-let-7f脑 ugagguagauuguauauaguu
HSA-MIR-98脑 ugagguaaguuguauuguu
海关a-let-7gSZ ugagguaguuguuguacagu
海关a-let-7i脑 ugagguaguugugugugugcugu
miR-138 948 954 1a HSA-MIR-138脑 Agcugguuguguugaauc
mir-141/200a 306 313 1A，M8 HSA-MIR-141 uaacacugucugugugugugaugg
海关a-miR-200a uaacacugucuguguguguaaacgaugu
mir-18 952 958 M8 HSA-MIR-18A uaagguggaugugcagaua
HSA-MIR-18B uaaggugcaucuagugcagua
MiR-200BC/429 215 222 1A，M8 海关a-miR-200b uaauacugccugguaaugaugac
海关a-miR-200c uaauacugccggguaaugaugg
海关a-miR-429 uaauacuguguguguguguaaaaaccgu
mir-203.1 265 271 1a 海关a-miR-203 ugaaauguuuaggaccacuag
mir-26 1625年 1632年 1A，M8 HSA-MIR-26A脑 Uucaaguaauccaggauaggc
HSA-MIR-26BSZ UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU
mir-31 656 663 1A，M8 HSA-MIR-31 Aggcaagaugcuggcauagcug
mir-320 360 366 1a 海关a-miR-320 aaaagcugggugagaggggcgaa
mir-338 335 341 M8 海关a-miR-338脑 uccagauuuuuguuga
miR-381 317 323 1a HSA-MIR-381 uauacaagggcaagcucucugu
miR-496 174 180 M8 HSA-MIR-496 Auuacauggccaaucuc
HSA-MIR-496 Auuacauggccaaucuc
mir-539 1284 1291 1A，M8 HSA-MIR-539 ggagaauuauccuuggugugu
HSA-MIR-539 ggagaauuauccuuggugugu
mir-544 406 412 M8 HSA-MIR-544 auucugcauuuuuuagcaagu
mir-7 286 292 M8 HSA-MIR-7SZ Uggaagacuaguuuuuguug