概括
基因 23132
象征 RAD54L2
同义词 arip4 | hspc325 | srisnf2l
描述 rad54样2(酿酒酵母)
参考 HGNC:HGNC:29123|ENSEMBL:ENSG00000164080|HPRD:10018|Vega:Otthumg00000152936
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3P21.2
Pascal P值 0.028
Sherlock P值 0.161
TADA P值 0.001
胎儿β 0.775
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 COMPOSITESET
Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM:Fromer_2014 整个外显子组测序分析 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。
DNM:Gulsuner_2013 整个外显子组测序分析 155 DNM通过外显子组对精神分裂症个体及其父母的三重奏测序确定。

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
RAD54L2 CHR3 51669785 G 一种 NM_015106 p.440r> q 错过 精神分裂症 DNM:Fromer_2014
RAD54L2 CHR3 51697209 G 一种 NM_015106 p.1393e> k 错过 精神分裂症 DNM:Gulsuner_2013

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17249314 CHR2 124344711 RAD54L2 23132 0.14 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
runx1 runx1t1融合单核细胞的TONKS目标 204 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MYC增强的Schlosser血清反应 108 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rizki肿瘤侵入性2D DN 64 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir34b和Mir34C的丰田目标 463 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshioka肝癌早期复发 40 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因