概括
基因 23133
象征 PHF8
同义词 JHDM1F | MRXSSD | ZNF422
描述 PhD手指蛋白8
参考 MIM:300560|HGNC:HGNC:20672|ENSEMBL:ENSG00000172943|HPRD:06599|Vega:Otthumg0000000021622
基因类型 蛋白质编码
地图位置 XP11.22
胎儿β -0.538
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS10994209 Chr10 61877705 PHF8 23133 0.19 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
aaas 0.84 0.84
ZNF691 0.84 0.82
SLC35B2 0.83 0.85
WDR8 0.83 0.81
CSNK2B 0.83 0.82
DVL2 0.83 0.79
FPGS 0.83 0.80
SNRPA 0.82 0.80
ADCK4 0.82 0.80
杜拉德 0.82 0.82
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.27 -0.67 -0.73
AF347015.8 -0.66 -0.73
MT-CO2 -0.65 -0.72
AF347015.31 -0.64 -0.71
mt-cyb -0.63 -0.72
AF347015.21 -0.63 -0.75
AF347015.33 -0.62 -0.69
AF347015.15 -0.61 -0.71
MT-ATP8 -0.61 -0.77
AF347015.2 -0.58 -0.71

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn 493 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘vmyb的目标 127 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Laiho结直肠癌锯齿状DN 86 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼肿瘤区分井与适度的 109 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Oct4目标 290 172 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath SOX2目标 734 436 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath NOS目标 179 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bacolod抗烷基化剂DN 60 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 419 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染24小时 148 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因