基因页:PHF8
概括?
基因 | 23133 |
象征 | PHF8 |
同义词 | JHDM1F | MRXSSD | ZNF422 |
描述 | PhD手指蛋白8 |
参考 | MIM:300560|HGNC:HGNC:20672|ENSEMBL:ENSG00000172943|HPRD:06599|Vega:Otthumg0000000021622 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | XP11.22 |
胎儿β | -0.538 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS10994209 | Chr10 | 61877705 | PHF8 | 23133 | 0.19 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
aaas | 0.84 | 0.84 |
ZNF691 | 0.84 | 0.82 |
SLC35B2 | 0.83 | 0.85 |
WDR8 | 0.83 | 0.81 |
CSNK2B | 0.83 | 0.82 |
DVL2 | 0.83 | 0.79 |
FPGS | 0.83 | 0.80 |
SNRPA | 0.82 | 0.80 |
ADCK4 | 0.82 | 0.80 |
杜拉德 | 0.82 | 0.82 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.27 | -0.67 | -0.73 |
AF347015.8 | -0.66 | -0.73 |
MT-CO2 | -0.65 | -0.72 |
AF347015.31 | -0.64 | -0.71 |
mt-cyb | -0.63 | -0.72 |
AF347015.21 | -0.63 | -0.75 |
AF347015.33 | -0.62 | -0.69 |
AF347015.15 | -0.61 | -0.71 |
MT-ATP8 | -0.61 | -0.77 |
AF347015.2 | -0.58 | -0.71 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn | 493 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘vmyb的目标 | 127 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Laiho结直肠癌锯齿状DN | 86 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼肿瘤区分井与适度的 | 109 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Oct4目标 | 290 | 172 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath NOS目标 | 179 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bacolod抗烷基化剂DN | 60 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 | 419 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染24小时 | 148 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stein Esrra目标 | 535 | 325 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |