概括
基因 23140
象征 Zzef1
同义词 zzz4
描述 锌指ZZ型和EF手域中包含1个
参考 HGNC:HGNC:29027|Ensembl:ENSG0000000074755|HPRD:15906|Vega:Otthumg0000000090741
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17p13.2
Pascal P值 0.042
Sherlock P值 0.241
胎儿β 0.474
支持 Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
TFG 0.88 0.83
Pigo 0.87 0.82
C7orf42 0.85 0.84
GNS 0.85 0.86
加纳布 0.85 0.84
dpagt1 0.85 0.82
WDR45L 0.84 0.76
C16orf62 0.84 0.80
GLB1 0.84 0.78
VPS52 0.83 0.76
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.70 -0.65
MT-CO2 -0.63 -0.60
AF347015.31 -0.62 -0.60
AF347015.8 -0.62 -0.60
AC098691.2 -0.59 -0.54
AF347015.27 -0.58 -0.57
AF347015.18 -0.58 -0.62
AF347015.33 -0.57 -0.55
mt-cyb -0.57 -0.56
AF347015.2 -0.56 -0.56

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
UDayakumar Med1靶向DN 240 171 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Koyama Sema3b靶向DN 411 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Haslinger B Cll具有17p13删除 21 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向 317 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Iwanaga癌变由Kras Pten DN 353 226 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI假足趋化性DN 457 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由PML Rara Fusion绑定的Martens 456 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 该途径中的所有SZGR 2.0基因