基因页：ankle2
概括？
| 基因 | 23141 |
| 象征 | ankle2 |
| 同义词 | KIAA0692 | LEMD7 | LEM4 | MCPH16 |
| 描述 | Ankyrin重复和包含2的LEM结构域 |
| 参考 | MIM：616062|HGNC：HGNC：29101|Ensembl：ENSG00000176915|Vega：Otthumg00000168046 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 12Q24.33 |
| Pascal P值 | 0.06 |
| 胎儿β | 0.457 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG16086185 | 12 | 133324413 | ankle2 | 5.065e-4 | -0.453 | 0.047 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| 是的 | 0.92 | 0.93 |
| ATXN7L3 | 0.92 | 0.91 |
| AACS | 0.91 | 0.90 |
| PNMA2 | 0.90 | 0.91 |
| mtpn | 0.90 | 0.89 |
| tspyl5 | 0.90 | 0.90 |
| DCLK1 | 0.89 | 0.92 |
| HK1 | 0.89 | 0.89 |
| DNAJC5 | 0.89 | 0.89 |
| DLG3 | 0.89 | 0.90 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MT-CO2 | -0.67 | -0.60 |
| AF347015.21 | -0.67 | -0.59 |
| AP002478.3 | -0.67 | -0.68 |
| FXYD1 | -0.66 | -0.60 |
| higd1b | -0.66 | -0.60 |
| AF347015.31 | -0.66 | -0.60 |
| AF347015.26 | -0.65 | -0.56 |
| AF347015.2 | -0.65 | -0.55 |
| AF347015.8 | -0.64 | -0.59 |
| AF347015.33 | -0.64 | -0.56 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Liu Sox4靶向DN | 309 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 周的炎症反应生活 | 485 | 293 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ginestier乳腺癌20Q13扩增DN | 180 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan MLL签名2 DN | 281 | 186 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 农民乳腺癌根源与腔内 | 326 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 农民乳腺癌根源与基础 | 330 | 217 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nikolsky乳腺癌12q24 Amplicon | 15 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 DN | 163 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Haslinger B Cll带有12个三体染色体 | 24 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML Fab标记 | 191 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血早期祖先 | 532 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染48小时DN | 504 | 323 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mir34b和Mir34C的丰田目标 | 463 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张乳腺癌祖细胞 | 425 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shedden肺癌的生存率差A6 | 456 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Han Satb1靶向 | 395 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 米利假足型haptotaxis dn | 668 | 419 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML带8 21易位 | 368 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PYEON CANCAR CANCAR HEAD和NECK与颈椎 | 193 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krieg缺氧不是通过KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| phong tnf响应不是通过p38 | 337 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |