基因页面:LRCH1
总结吗?
| GeneID | 23143年 |
| 象征 | LRCH1 |
| 同义词 | CHDC1 | NP81 |
| 描述 | 富亮氨酸重复和calponin同源性(CH)域包含1 |
| 参考 | MIM: 610368|HGNC: HGNC: 20309|运用:ENSG00000136141|HPRD: 14307|织女:OTTHUMG00000016877 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 13 q14.11 |
| 帕斯卡假定值 | 0.084 |
| 胎儿β | 0.353 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg20250874 | 13 | 47127354 | LRCH1 | 1.92平台以及 | -0.032 | 5.45 e - | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs16869851 | chr4 | 20690056 | LRCH1 | 23143年 | 0.15 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| DN GOZGIT ESR1目标 | 781年 | 465年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GAUSSMANN MLL AF4融合目标C | 170年 | 114年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MORI浆细胞DN | 33 | 20. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 崔TCF21目标2 DN | 830年 | 547年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 江VHL目标 | 138年 | 91年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LEIN小脑标记 | 85年 | 47 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 郑受FOXP3 | 491年 | 310年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 郑FOXP3在胸腺的目标 | 196年 | 137年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 郑FOXP3目标T淋巴细胞DN | 37 | 29日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 巨噬细胞培养宽容DN | 409年 | 268年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 尼尔森要点 | 98年 | 66年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MIYAGAWA EWSR1 ETS的目标融合起来 | 259年 | 159年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| TORCHIA EWSR1 FLI1融合DN的目标 | 321年 | 200年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ZWANG类1引起的暂时性的EGF | 516年 | 308年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |