基因页:FCHO1
概括?
基因 | 23149 |
象征 | FCHO1 |
同义词 | - |
描述 | FCH域仅1 |
参考 | MIM:613437|HGNC:HGNC:29002|Ensembl:ENSG00000130475|HPRD:16887|Vega:Otthumg00000183293 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19p13.11 |
Pascal P值 | 0.02 |
Sherlock P值 | 0.805 |
主持人 | 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS201062 | Chr10 | 10985931 | FCHO1 | 23149 | 0.13 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/FCHO1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
CHD8 | 0.98 | 0.98 |
SUV420H1 | 0.97 | 0.97 |
KDM4A | 0.97 | 0.98 |
ZNF518B | 0.96 | 0.97 |
TCEB3 | 0.96 | 0.96 |
C6orf174 | 0.96 | 0.97 |
asxl1 | 0.96 | 0.97 |
Med1 | 0.96 | 0.97 |
ZNF623 | 0.96 | 0.97 |
rspry1 | 0.96 | 0.97 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AIFM3 | -0.75 | -0.80 |
HLA-F | -0.75 | -0.79 |
AF347015.31 | -0.75 | -0.91 |
MT-CO2 | -0.74 | -0.92 |
FXYD1 | -0.74 | -0.91 |
TSC22D4 | -0.74 | -0.82 |
AF347015.27 | -0.74 | -0.89 |
S100B | -0.74 | -0.85 |
C5orf53 | -0.74 | -0.76 |
AF347015.33 | -0.73 | -0.87 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Koyama Sema3b靶向DN | 411 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GC期DN的pasqualucci淋巴瘤 | 165 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Peng Leucine剥夺DN | 187 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HU基因毒素作用直接与间接24小时 | 55 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DASU IL6信号疤痕向上 | 30 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee转移和替代剪接DN | 45 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bonome卵巢癌的生存不良DN | 22 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bonome卵巢癌的生存次优秀 | 510 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌的生存率差A6 | 456 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tavazoie转移 | 108 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dasu IL6信号向上 | 59 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 | 281 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组D的UVC响应 | 280 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |