概括
基因 23149
象征 FCHO1
同义词 -
描述 FCH域仅1
参考 MIM:613437|HGNC:HGNC:29002|Ensembl:ENSG00000130475|HPRD:16887|Vega:Otthumg00000183293
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19p13.11
Pascal P值 0.02
Sherlock P值 0.805
主持人 小脑
迈尔斯的顺式和跨性别
支持 COMPOSITESET
Darnell FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS201062 Chr10 10985931 FCHO1 23149 0.13 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CHD8 0.98 0.98
SUV420H1 0.97 0.97
KDM4A 0.97 0.98
ZNF518B 0.96 0.97
TCEB3 0.96 0.96
C6orf174 0.96 0.97
asxl1 0.96 0.97
Med1 0.96 0.97
ZNF623 0.96 0.97
rspry1 0.96 0.97
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AIFM3 -0.75 -0.80
HLA-F -0.75 -0.79
AF347015.31 -0.75 -0.91
MT-CO2 -0.74 -0.92
FXYD1 -0.74 -0.91
TSC22D4 -0.74 -0.82
AF347015.27 -0.74 -0.89
S100B -0.74 -0.85
C5orf53 -0.74 -0.76
AF347015.33 -0.73 -0.87

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Koyama Sema3b靶向DN 411 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GC期DN的pasqualucci淋巴瘤 165 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Peng Leucine剥夺DN 187 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HU基因毒素作用直接与间接24小时 55 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DASU IL6信号疤痕向上 30 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee转移和替代剪接DN 45 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bonome卵巢癌的生存不良DN 22 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bonome卵巢癌的生存次优秀 510 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌的生存率差A6 456 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tavazoie转移 108 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dasu IL6信号向上 59 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 281 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组D的UVC响应 280 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因