基因页：CIC

概括？
基因 23152
象征 CIC
同义词 -
描述 Capicua转录阻遏物
参考 MIM：612082|HGNC：HGNC：14214|Ensembl：ENSG00000079432|HPRD：10831|Vega：Otthumg00000182794
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19q13.2
Pascal P值 0.125
Sherlock P值 0.19
TADA P值 0.027
胎儿β 0.964
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 COMPOSITESET
Darnell FMRP目标
Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM：Fromer_2014 整个外显子组测序分析 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究，该研究使用基因组DNA报告了DNM。
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献：0.0505

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 筛 CG46 特征 学习
CIC CHR19 42791987 A G NM_015125 p.264h> r 错过 精神分裂症 DNM：Fromer_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16829545 CHR2 151977407 CIC 23152 1.779E-4 反式
RS3845734 CHR2 171125572 CIC 23152 0.18 反式
RS7787830 CHR7 98797019 CIC 23152 0.18 反式
RS16955618 CHR15 29937543 CIC 23152 0 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
GTSE1 0.99 0.84
kif2c 0.98 0.79
NUSAP1 0.98 0.81
CDCA8 0.98 0.76
kif20a 0.98 0.80
TACC3 0.98 0.73
ORC1L 0.98 0.77
GSG2 0.98 0.79
kif4a 0.98 0.81
CDK2 0.98 0.66
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C5orf53 -0.39 -0.69
FBXO2 -0.39 -0.65
HLA-F -0.39 -0.72
pth1r -0.39 -0.69
SLC9A3R2 -0.38 -0.46
aldoc -0.38 -0.69
AIFM3 -0.38 -0.70
asphd1 -0.37 -0.53
AF347015.27 -0.37 -0.80
LHPP -0.37 -0.57

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0003677 DNA结合 IEA -
去：0005515 蛋白质结合 IPI 16713569
去：0005215 转运蛋白活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0006355 调节转录，DNA依赖性的调节 IEA -
去：0006350 转录 IEA -
去：0006810 运输 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005634 核 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
deurig t细胞促进性白血病 368 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王攀登目标 269 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ginestier乳腺癌Znf217扩增DN 335 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath循环基因 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard粉碎和燃烧突变体 197 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard BMYB Morpholino Up 205 126 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DASU IL6信号疤痕向上 30 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因