基因页：NCDN
概括？
| 基因 | 23154 |
| 象征 | NCDN |
| 同义词 | - |
| 描述 | 神经软骨素 |
| 参考 | MIM：608458|HGNC：HGNC：17597|Ensembl：ENSG00000020129|HPRD：10530|Vega：Otthumg00000059204 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1p34.3 |
| Pascal P值 | 5.317E-5 |
| Sherlock P值 | 0.486 |
| 胎儿β | -2.073 |
| 主持人 | 小脑半球 |
| 支持 | g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| PTOV1 | 0.94 | 0.95 |
| SF3B4 | 0.94 | 0.91 |
| CSNK2B | 0.94 | 0.94 |
| tinf2 | 0.94 | 0.94 |
| B4GALT3 | 0.93 | 0.92 |
| dedd | 0.93 | 0.91 |
| PCIF1 | 0.92 | 0.92 |
| BAT3 | 0.92 | 0.90 |
| FTSJ1 | 0.92 | 0.91 |
| 第13节 | 0.92 | 0.91 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.27 | -0.79 | -0.87 |
| MT-CO2 | -0.77 | -0.84 |
| AF347015.31 | -0.76 | -0.84 |
| AF347015.8 | -0.76 | -0.86 |
| AF347015.33 | -0.75 | -0.84 |
| mt-cyb | -0.75 | -0.85 |
| AF347015.15 | -0.72 | -0.83 |
| C5orf53 | -0.70 | -0.72 |
| AF347015.26 | -0.70 | -0.85 |
| AF347015.2 | -0.70 | -0.84 |
第三节。基因本体论注释
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| GO：0045453 | 骨吸收 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0042995 | 细胞投影 | IEA | Axon（GO术语级别：4） | - |
| 去：0005737 | 细胞质 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| deurig t细胞促进性白血病 | 368 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Doane对雄激素DN的反应 | 241 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌 | 443 | 294 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 UP | 309 | 199 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 约翰逊脑癌早期与晚期DN | 45 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Stark前额叶皮层22Q11删除 | 195 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过nova2拼接 | 43 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kaab失败的心房 | 38 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN | 287 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Varela ZMPSTE24目标 | 40 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HU遗传毒性损伤4小时 | 35 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1靶向DN | 543 | 317 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zheng胶质母细胞瘤可塑性 | 250 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 肌肉DN中的罗马胰岛素靶标 | 204 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YAO对孕酮簇7的时间反应7 | 76 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim所有疾病Calb1 Corr Up | 548 | 370 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-149 | 795 | 801 | M8 | HSA-MIR-149脑 | Ucuggcuccucuucuucacuccc |
| mir-320 | 118 | 124 | M8 | HSA-MIR-320 | aaaagcugggugagaggggcgaa |
| mir-370 | 931 | 937 | M8 | HSA-MIR-370脑 | gccugggggguggaaccugg |