基因页:NUP205
概括?
基因 | 23165 |
象征 | NUP205 |
同义词 | C7orf14 |
描述 | 核孔蛋白205KDA |
参考 | MIM:614352|HGNC:HGNC:18658|ENSEMBL:ENSG00000155561|HPRD:17653|Vega:Otthumg00000155497 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7Q33 |
Pascal P值 | 0.091 |
Sherlock P值 | 0.556 |
胎儿β | 1.135 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS292553 | CHR7 | 134871347 | NUP205 | 23165 | 0.19 | 顺式 | ||
RS292554 | CHR7 | 134871384 | NUP205 | 23165 | 0.18 | 顺式 | ||
RS292601 | CHR7 | 134895531 | NUP205 | 23165 | 0.14 | 顺式 | ||
RS9609757 | CHR22 | 33701526 | NUP205 | 23165 | 0.08 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/NUP205_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
otud5 | 0.84 | 0.79 |
ABCF3 | 0.83 | 0.80 |
AMPD2 | 0.83 | 0.79 |
CSNK1G2 | 0.82 | 0.78 |
rangap1 | 0.82 | 0.79 |
rad23a | 0.82 | 0.74 |
PCYOX1L | 0.82 | 0.77 |
scyl1 | 0.81 | 0.76 |
dennd4b | 0.81 | 0.79 |
Prkaca | 0.81 | 0.78 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.65 | -0.38 |
GNG11 | -0.60 | -0.47 |
AF347015.18 | -0.57 | -0.31 |
MT-CO2 | -0.56 | -0.34 |
鼻孔 | -0.55 | -0.36 |
IL32 | -0.55 | -0.36 |
AF347015.31 | -0.55 | -0.34 |
AF347015.8 | -0.54 | -0.32 |
FAM159B | -0.54 | -0.58 |
clec2b | -0.53 | -0.38 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
非编码RNA的反应组代谢 | 49 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
IFN刺激基因的反应组抗病毒机制 | 66 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
含有前mRNA的封顶内含子的反应组处理 | 140 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
成熟转录本向细胞质的反应组传输 | 54 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
小分子的反应组跨膜转运 | 413 | 270 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome mRNA处理 | 161 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
源自内在转录本的成熟mRNA的反应组传输 | 33 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome SLC介导的跨膜运输 | 241 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome葡萄糖转运 | 38 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
READEM RNA的代谢 | 330 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome干扰素信号传导 | 159 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
碳水化合物的反应组代谢 | 247 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome流感生命周期 | 203 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome NEP NS2与细胞出口机械相互作用 | 27 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome HIV感染 | 207 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
核糖核蛋白转运到宿主核的反应组转运 | 27 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome HIV生命周期 | 125 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome宿主的艾滋病毒因素的相互作用 | 132 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome HIV生命周期的后期 | 104 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
VPR与宿主细胞蛋白的反应组相互作用 | 33 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
葡萄糖激酶调节蛋白对葡萄糖激酶的反应组调节 | 27 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 | 270 | 204 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tien肠益生菌24小时 | 557 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
OUELLET卵巢癌侵入性与LMP UP | 117 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN | 514 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana BRCA2 PCC网络 | 423 | 265 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔卡拉凋亡 | 88 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MANALO缺氧DN | 289 | 166 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李肝癌电抗 | 60 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Liver Cancer Dena Up | 60 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭谷氨酰胺剥夺DN | 337 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
整合素信号传导 | 59 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 DN | 163 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血晚期祖先 | 544 | 307 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德斯癌元签名 | 64 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
布朗HCMV感染48小时 | 180 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mitsiades对aplidin DN的反应 | 249 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌亚类未注释的DN | 193 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fournier腺泡开发2 | 277 | 172 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤上课 | 605 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Roessler肝癌转移 | 107 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |