概括
基因 23167
象征 EFR3A
同义词 -
描述 EFR3同源物a
参考 MIM:611798|HGNC:HGNC:28970|ENSEMBL:ENSG00000132294|HPRD:17179|Vega:Otthumg00000150552
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8Q24.22
Pascal P值 0.341
Sherlock P值 0.663
胎儿β -1.711
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG01956158 8 132916947 EFR3A 2.17E-10 -0.027 5.92E-7 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2403775 CHR8 133472361 EFR3A 23167 0.08 顺式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Znf32 0.86 0.90
DCTN3 0.86 0.88
UFD1L 0.86 0.90
COQ3 0.85 0.89
ING4 0.85 0.89
IAH1 0.84 0.88
polb 0.84 0.90
SCNM1 0.84 0.86
GTF2A2 0.84 0.87
TSG101 0.83 0.89
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ZBTB7B -0.65 -0.77
EPAS1 -0.65 -0.76
SLC6A12 -0.64 -0.74
ABCB1 -0.64 -0.71
myh14 -0.64 -0.76
AL132868.3 -0.63 -0.72
apol3 -0.63 -0.74
AF347015.26 -0.63 -0.79
sema3g -0.63 -0.70
ptrf -0.62 -0.71

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
通过CD40 DN的Hollmann凋亡 267 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OUELLET卵巢癌侵入性与LMP UP 117 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark Hyppocampus 22Q11删除 53 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cheok对胃嘌呤和LD MTX的反应 10 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FAELT B CLL与VH重新排列 48 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 182 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sesto对UV C4的反应 20 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王顺铂反应和XPC DN 228 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
贝尔德糖尿病性肾病DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性5 482 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Riggins他莫昔芬抵抗DN 220 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足 518 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G6 UP 65 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG RXRA与H4K20me1标记结合 145 82 该途径中的所有SZGR 2.0基因