SZGR2 - Beplay体育中心

Summary？

基因	2317
象征	flnb
Synonyms	ABP-278\|ABP-280\|AOI\|FH1\|FLN-B\|FLN1L\|LRS1\|SCT\|TABP\|TAP
Description	Filamin b
Reference	MIM:603381\|HGNC：HGNC：3755\|ENSEMBL：ENSG00000136068\|HPRD：04543\|Vega：Otthumg00000159158
基因类型	蛋白质编码
地图上的位置	3P14.3
Pascal P值	0.128
Sherlock p-value	0.77
胎儿β	0.23
DMG	1(# studies)
主持人	尾状基底神经节 Myers' cis & trans
支持	Ascano FMRP目标

Gene in Data Sources

基因集名称	Method of gene set	Description	信息
简历：PGCNP	全基因组协会研究	GWAS
DMG：Wockner_2014	全基因组DNA甲基化分析	该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。	1
协会	A combined odds ratio method (Sun等。2008), association studies	1	链接到Szgene
go_annotation	将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释	与神经相关的关键字的命中：1

Section I. Genetics and epigenetics annotation

差异甲基化基因

探针	染色体	位置	最近的基因	p（dis）	Beta (dis)	fdr（dis）	学习
cg23730027	3	57995180	flnb	3.587E-4	0.494	0.042	DMG：Wockner_2014

EQTL注释

SNP ID	染色体	位置	主持人	Gene Entrez ID	QVALUE	EQTL类型
RS3755427	CHR2	160219680	flnb	2317	0.17	反式
RS3771686	CHR2	160220163	flnb	2317	0.11	反式
RS6753635	CHR2	160236989	flnb	2317	0.07	反式
RS7062071	Chrx	17724830	flnb	2317	1.342E-4	反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

No co-expressed genes in brain regions

第三节。基因本体论注释

分子功能	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
GO:0003779	肌动蛋白结合	nas		8327473
去：0005515	蛋白质结合	IPI		10676904\|16076904
生物过程	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0007519	skeletal muscle development	IEA	神经元（GO期限：8）	-
去：0007165	信号转导	TAS		8327473
去：0007016	细胞骨架锚定在质膜上	TAS		9694715
去：0007275	multicellular organismal development	IEA		-
去：0030154	细胞分化	IEA		-
去：0030036	肌动蛋白细胞骨架组织	TAS		8327473
Cellular component	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0001725	压力纤维	IEA		-
去：0005634	nucleus	艾达		18029348
去：0005737	cytoplasm	IEA		-
GO：0016021	膜不可或缺	nas		8327473
GO:0005925	局灶性粘附	IEA		-
GO:0015629	肌动蛋白细胞骨架	TAS		9651345

Section V. Pathway annotation

路径名	路径大小	# SZGR 2.0 genes in pathway	信息
kegg mapk信号通路	267	205	All SZGR 2.0 genes in this pathway
kegg焦点粘附	201	138	All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME ANTIVIRAL MECHANISM BY IFN STIMULATED GENES	66	45	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome干扰素信号传导	159	116	All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME免疫系统	933	616	All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME CYTOKINE SIGNALING IN IMMUNE SYSTEM	270	204	All SZGR 2.0 genes in this pathway
迪亚兹慢性巨型性白血病DN	116	79	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Doane对雄激素的反应	184	125	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Basaki YBX1靶向	290	177	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Rodrigues NTN1靶向DN	158	102	All SZGR 2.0 genes in this pathway
NUP98 HOXA9 Fusion 10D的Takeda目标	194	122	All SZGR 2.0 genes in this pathway
NUP98 HOXA9 Fusion 16D的Takeda目标	175	108	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lopez中端瘤的生存时间上升	14	8	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bilban b cll lpl up	63	39	All SZGR 2.0 genes in this pathway
runx1 runx1t1融合单核细胞的TONKS目标	204	140	All SZGR 2.0 genes in this pathway
洛佩兹间皮瘤生存最差与最好的	14	10	All SZGR 2.0 genes in this pathway
EWSR1 FLII融合DN的Kinsey目标	329	219	All SZGR 2.0 genes in this pathway
ELVIDGE HYPOXIA UP	171	112	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wamunyokoli卵巢癌LMP	265	158	All SZGR 2.0 genes in this pathway
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN	805	505	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Berenjeno由Rhoa Forever DN转变	31	23	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Landis Erbb2乳腺肿瘤324向上	150	93	All SZGR 2.0 genes in this pathway
berenjeno由Rhoa Up Troment	536	340	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PAX3 FOXO1融合DN的Begum目标	45	34	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dauer Stat3靶向	49	35	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN	855	609	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN	483	336	All SZGR 2.0 genes in this pathway
STARK PREFRONTAL CORTEX 22Q11 DELETION UP	195	138	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Sakai肿瘤浸润单核细胞	27	19	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Onder CDH1目标2 DN	464	276	All SZGR 2.0 genes in this pathway
tarte浆细胞与Plasmablast向上	398	262	All SZGR 2.0 genes in this pathway
BYSTRYKH HEMATOPOIESIS STEM CELL QTL TRANS	882	572	All SZGR 2.0 genes in this pathway
ZHAN MULTIPLE MYELOMA LB UP	48	28	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Cromer转移DN	81	58	All SZGR 2.0 genes in this pathway
NPM1突变DN的Verhaak AML	246	180	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Sesto对UV C8的反应	72	56	All SZGR 2.0 genes in this pathway
HENDRICKS SMARCA4 TARGETS UP	56	35	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kang氟尿嘧啶抵抗DN	16	10	All SZGR 2.0 genes in this pathway
伯顿成生成8	86	57	All SZGR 2.0 genes in this pathway
XU GH1外源目标	85	50	All SZGR 2.0 genes in this pathway
伊万诺娃造血细胞和祖细胞	681	420	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bild HRAS致癌特征	261	166	All SZGR 2.0 genes in this pathway
CREIGHTON ENDOCRINE THERAPY RESISTANCE 1	528	324	All SZGR 2.0 genes in this pathway
CREIGHTON ENDOCRINE THERAPY RESISTANCE 4	307	185	All SZGR 2.0 genes in this pathway
FOSTER TOLERANT MACROPHAGE DN	409	268	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默	461	298	All SZGR 2.0 genes in this pathway
MASSARWEH TAMOXIFEN RESISTANCE DN	258	160	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Massarweh对雌二醇的反应	61	47	All SZGR 2.0 genes in this pathway
张乳腺癌祖细胞DN	145	93	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mirlet7a3 DN的Brueckner目标	78	49	All SZGR 2.0 genes in this pathway
公园维甲酸响应和RARA PLZF融合	22	14	All SZGR 2.0 genes in this pathway
MILI假足趋化性DN	457	302	All SZGR 2.0 genes in this pathway
MILI PSEUDOPODIA HAPTOTAXIS DN	668	419	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Valk AML群集10	33	22	All SZGR 2.0 genes in this pathway
POOLA INVASIVE BREAST CANCER DN	134	83	All SZGR 2.0 genes in this pathway
YAGI AML WITH T 9 11 TRANSLOCATION	130	87	All SZGR 2.0 genes in this pathway
洛佩兹间皮瘤生存总体DN	16	8	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Fournier腺泡开发2	277	172	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hoshida肝癌亚类S2	115	74	All SZGR 2.0 genes in this pathway
黄成人组织茎模块	721	492	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Karlsson TGFB1靶向	127	78	All SZGR 2.0 genes in this pathway
由PML Rara Fusion绑定的Martens	456	287	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dutertre雌二醇反应6小时	229	149	All SZGR 2.0 genes in this pathway
BHAT ESR1 TARGETS NOT VIA AKT1 UP	211	131	All SZGR 2.0 genes in this pathway
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标	281	183	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Johnstone Parvb目标3	430	288	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gobert少突胶质细胞分化DN	1080	713	All SZGR 2.0 genes in this pathway
IRS1和IRS2的GUO目标	98	67	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Plasari TGFB1靶向10小时	199	143	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Fortschegger PHF8靶向DN	784	464	All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族	目标位置			miRNA ID	mirna seq
mirna家族	UTR开始	UTR结束	匹配方法	miRNA ID	mirna seq
miR-145	1422	1429	1A，M8	HSA-MIR-145	guccaguuucccaggaaucccuu

SZ：在精神分裂症患者的脑皮质中差异表达的miRNA与使用微阵列进行对照样品进行比较。点击hereto see the list of SZ related miRNAs.
大脑：基于miRNA微阵列表达研究在大脑中表达的miRNA。点击here查看与大脑相关的miRNA列表。

基因页：flnb