基因页：GPD1L

Summary？
基因ID 23171
象征 GPD1L
同义词 gpd1-l
描述 甘油-3-磷酸脱氢酶1类样
参考 MIM：611778|HGNC：HGNC：28956|ENSEMBL：ENSG00000152642|HPRD：10008|Vega：Otthumg00000155846
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3P22.3
Pascal P值 0.04
Sherlock P值 0.242
主持人 额叶皮质BA9
迈尔斯的顺式和跨性别
元

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 Psr: 0.006

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1561519 CHR2 35823020 GPD1L 23171 0.1 反式
RS7591339 CHR2 35825597 GPD1L 23171 0.1 反式
RS7570146 CHR2 35844751 GPD1L 23171 0.1 反式
RS1439691 CHR2 35851281 GPD1L 23171 0.1 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
DGKZ 0.94 0.90
ICAM5 0.92 0.90
KCNN1 0.91 0.89
Arhgef4 0.90 0.84
CHRD 0.90 0.88
extl1 0.89 0.89
FAM131A 0.89 0.86
SLC17A7 0.88 0.85
CHRM1 0.88 0.82
FMNL1 0.88 0.86
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
KIAA1949 -0.55 -0.42
RBMX2 -0.55 -0.61
tubb2b -0.54 -0.49
LEMD1 -0.54 -0.50
FNBP1L -0.52 -0.34
ZNF300 -0.52 -0.35
IDH1 -0.52 -0.42
ZNF193 -0.52 -0.42
Tigd1 -0.52 -0.41
HEBP2 -0.52 -0.64

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005488 捆绑 IEA -
去：0004367 甘油-3-磷酸脱氢酶（NAD+）活性 IEA -
GO：0051287 NAD结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005975 碳水化合物代谢过程 IEA -
GO：0046168 甘油-3-磷酸分解代谢过程 IEA -
GO：0055114 还原氧化 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005737 细胞质 IEA -
去：0009331 3-磷酸​​甘油脱氢酶复合物 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
KEGG甘油磷脂代谢 77 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组甘油三酸酯的生物合成 38 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组磷脂代谢 198 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PA的反应组合成 27 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组甘油磷脂生物合成 82 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组脂肪酸三酰甘油和酮体代谢 168 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘前列腺癌DN 481 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken紫菜叶黑色素瘤DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础 380 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质 450 256 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多恩乳腺癌课程 72 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Basaki YBX1靶向DN 384 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN 805 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌变性DN 537 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Provenzani转移DN 136 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与基础 330 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌基础与仙女 330 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼肿瘤分化好VS适度 109 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GC期DN的pasqualucci淋巴瘤 165 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark Hyppocampus 22Q11删除 53 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MANALO缺氧DN 289 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schuhmacher MYC的目标 80 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bild MYC致癌签名 206 117 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
monnier tradiatiation肿瘤逃脱 393 244 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄达沙替尼抵抗DN 69 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌ESR1 UP 167 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌良好生存A4 196 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类增殖 178 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2同工型的Pedersen转移7 403 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Alfano MYC目标 239 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌簇6 16 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-139 2743 2749 M8 HSA-MIR-139脑 ucuacagugcacgugucu
mir-181 2480 2487 1A，M8 HSA-MIR-181A脑 aacauucaacgcugucggugagu
HSA-MIR-181BSZ aacauucauugcugucggggg
HSA-MIR-181C脑 aacauucaaccugucggugagu
HSA-MIR-181D脑 aacauucauuguugucggggguggguu
mir-210 1632年 1638年 M8 HSA-MIR-210 cugugcgugugugacagcggcuga
mir-27 2477 2483 1a HSA-MIR-27A脑 uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27B脑 uucacaguggcuaaguucugc