基因页:metap1
概括?
基因 | 23173 |
象征 | metap1 |
同义词 | map1a | metap1a |
描述 | 甲基氨基肽酶1 |
参考 | MIM:610151|HGNC:HGNC:15789|ENSEMBL:ENSG00000164024|HPRD:10071|Vega:Otthumg00000161231 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 4Q23 |
Pascal P值 | 0.824 |
Sherlock P值 | 0.294 |
胎儿β | 0.201 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 小脑半球 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG04787407 | 4 | 99916511 | metap1 | 5.09e-8 | -0.008 | 1.35E-5 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/METAP1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
KIF24 | 0.84 | 0.60 |
yap1 | 0.84 | 0.74 |
nedd1 | 0.84 | 0.65 |
MSN | 0.83 | 0.73 |
NR2E1 | 0.82 | 0.76 |
PRKD1 | 0.82 | 0.79 |
TMEM123 | 0.80 | 0.67 |
myo3a | 0.80 | 0.44 |
9月2日 | 0.80 | 0.81 |
PDPN | 0.80 | 0.51 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
NPM2 | -0.29 | -0.24 |
Fabp3 | -0.28 | -0.26 |
asphd1 | -0.26 | -0.18 |
ADAP1 | -0.26 | -0.16 |
Arhgdig | -0.25 | -0.26 |
Kazald1 | -0.25 | -0.21 |
FXYD7 | -0.25 | -0.18 |
ephx4 | -0.24 | -0.22 |
CAMK1 | -0.24 | -0.20 |
CA4 | -0.24 | -0.20 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Mullighan MLL签名1 DN | 242 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名2 DN | 281 | 186 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser MYC靶标和血清反应 | 47 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA XPRSS INT网络 | 168 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana BRCA2 PCC网络 | 423 | 265 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana BRCA中心网络 | 117 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔卡拉凋亡 | 88 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WEI mir34a目标 | 148 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shepard BMYB Morpholino Up | 205 | 126 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
JAIN NFKB信号 | 75 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kaab心脏中心与心室DN | 261 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sesto对UV C5的反应 | 46 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甜肺癌Kras DN | 435 | 289 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇的时间反应14 | 143 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Alfano MYC目标 | 239 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |