Summary
基因ID 23175
象征 LPIN1
同义词 Pap1
描述 Lipin 1
参考 MIM:605518|HGNC:HGNC:13345|ENSEMBL:ENSG00000134324|HPRD:09271|Vega:Otthumg00000119082
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2P25.1
Pascal P值 0.026
Sherlock P值 0.363
胎儿β -0.224
DMG 1(#研究)
主持人 尾状基底神经节
小脑半球
小脑
皮质
额叶皮质BA9
海马
下丘脑
梭子基底神经节
支持 Ascano FMRP目标

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG00523161 2 11888753 LPIN1 1.839E-4 0.359 0.034 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS3795974 2 11924950 LPIN1 ENSG00000134324.7 6.61482E-7 0.02 107229 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CNTNAP1 0.77 0.75
DNM1 0.76 0.74
galnt9 0.76 0.70
SLC12A5 0.76 0.73
EHD3 0.76 0.68
Faim2 0.75 0.71
SCN2B 0.75 0.68
ablim2 0.75 0.71
TPRG1L 0.75 0.74
got1 0.75 0.74
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SH3BP2 -0.50 -0.59
SMTN -0.49 -0.54
NME4 -0.48 -0.58
透明2 -0.47 -0.50
RBMX2 -0.47 -0.51
FADS2 -0.46 -0.49
SH2B2 -0.46 -0.51
pde9a -0.46 -0.49
SH2D2A -0.46 -0.51
C14orf93 -0.46 -0.46

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
反应组甘油三酸酯的生物合成 38 26 All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组磷脂代谢 198 112 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PC的Reactome合成 18 9 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME GLYCEROPHOSPHOLIPID BIOSYNTHESIS 82 39 All SZGR 2.0 genes in this pathway
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组脂肪酸三酰甘油和酮体代谢 168 115 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Onken紫菜叶黑色素瘤DN 526 357 All SZGR 2.0 genes in this pathway
威尔科克斯对孕酮的反应 152 90 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gary CD5目标 473 314 All SZGR 2.0 genes in this pathway
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hoebeke淋巴干细胞向上 95 64 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Senese HDAC3靶向 501 327 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Jaatinen造血干细胞向上 316 190 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Graessmann血清剥夺DN的细胞凋亡 234 147 All SZGR 2.0 genes in this pathway
landis erbb2乳房肿瘤型DN 55 33 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Graessmann对MC和血清剥夺DN的反应 84 54 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Graessmann对MC和阿霉素的反应 612 367 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gaussmann MLL AF4融合靶标C向上 170 114 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Landis Erbb2乳腺肿瘤324 DN 149 93 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Berenjeno由Rhoa DN转变 394 258 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LastOwska与MYCN二式增长 43 29 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kobayashi对romidepsin的反应 19 14 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mohankumar TLX1靶向 414 287 All SZGR 2.0 genes in this pathway
杨乳腺癌ESR1散装DN 23 15 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Tomlins前列腺癌DN 40 33 All SZGR 2.0 genes in this pathway
liang造血细胞数大与微小的DN 45 24 All SZGR 2.0 genes in this pathway
里克曼肿瘤区分良好,而不是很差 236 139 All SZGR 2.0 genes in this pathway
RICKMAN TUMOR DIFFERENTIATED WELL VS MODERATELY UP 109 69 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Goldrath免疫记忆 65 42 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Affar YY1目标 214 133 All SZGR 2.0 genes in this pathway
对顺铂的反应 22 11 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ongusaha TP53目标 38 23 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏症疾病 1691 1088 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kayo衰老肌肉DN 123 76 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Browne HCMV感染48小时DN 504 323 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伯顿成生成5 126 78 All SZGR 2.0 genes in this pathway
对甲氨蝶呤的反应 26 16 All SZGR 2.0 genes in this pathway
大脑衰老 262 186 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Brachat对Camptothecin的反应 28 18 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hedenfalk乳腺癌BRCA1与BRCA2 163 113 All SZGR 2.0 genes in this pathway
monnier tradiatiation肿瘤逃脱DN 373 196 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CREIGHTON ENDOCRINE THERAPY RESISTANCE 3 720 440 All SZGR 2.0 genes in this pathway
马丁内斯RB1靶向 673 430 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez TP53目标DN 593 372 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez RB1和TP53靶向 601 369 All SZGR 2.0 genes in this pathway
OUILLETTE CLL 13Q14删除DN 60 38 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Cheng由雌二醇印记 110 68 All SZGR 2.0 genes in this pathway
韦伯甲基化的HCP成纤维细胞DN 42 22 All SZGR 2.0 genes in this pathway
精子中的韦伯甲基化的HCP 20 13 All SZGR 2.0 genes in this pathway
TGFB1和WNT3A的LABBE目标 111 70 All SZGR 2.0 genes in this pathway
西部肾上腺皮质肿瘤 294 199 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BEIER GLIOMA STEM CELL DN 66 42 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mootha PGC 420 269 All SZGR 2.0 genes in this pathway
李肝癌的生存 185 112 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Chang Core血清反应DN 209 137 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Vantveer乳腺癌ESR1 DN 240 153 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Valk AML群集2 29 14 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boyault肝癌子类G6 UP 65 43 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YAGI AML WITH INV 16 TRANSLOCATION 422 277 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hoshida肝癌亚类S3 266 180 All SZGR 2.0 genes in this pathway
古铁雷斯慢性淋巴细胞性白血病 12 5 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kyng Werner综合征和正常老化DN 225 124 All SZGR 2.0 genes in this pathway
黄成人组织茎模块 721 492 All SZGR 2.0 genes in this pathway
中村脂肪形成晚了 104 67 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Qi缺氧 140 96 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gabriely miR21靶标 289 187 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CHYLA CBFA2T3靶向DN 242 146 All SZGR 2.0 genes in this pathway
棕熊UVC响应中间 98 56 All SZGR 2.0 genes in this pathway
FEVR CTNNB1靶向 682 433 All SZGR 2.0 genes in this pathway
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 All SZGR 2.0 genes in this pathway