基因页:FLT1
Summary?
GeneID | 2321 |
Symbol | FLT1 |
同义词 | flt | flt-1 | vegfr-1 | vegfr1 |
描述 | FMS相关酪氨酸激酶1 |
参考 | MIM:165070|HGNC:HGNC:3763|ENSEMBL:ENSG00000102755|HPRD:01297|Vega:Otthumg0000000016648 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 13Q12 |
Pascal P值 | 0.131 |
胎儿β | -0.723 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 元 |
Gene in Data Sources
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG14283783 | 13 | 29069941 | FLT1 | 6.62e-5 | -0.506 | 0.024 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/FLT1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
Section IV. Protein-protein interaction annotation
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | Source | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
KDR | CD309 |flk1 |VEGFR |VEGFR2 | kinase insert domain receptor (a type III receptor tyrosine kinase) | - | HPRD | 10865839 |
KDR | CD309 |flk1 |VEGFR |VEGFR2 | kinase insert domain receptor (a type III receptor tyrosine kinase) | 生化活动 | Biogrid | 12796773 |
NCK1 | MGC12668 |NCK |nckalpha | NCK适配器蛋白1 | Flt-1 interacts with Nck. | 绑定 | 9600074 |
PGF | D12S1900 |PGFL |PLGF |PLGF-2 |SHGC-10760 | placental growth factor | - | HPRD,Biogrid | 9452434 |
PIK3R1 | grb1 |P85 |p85-alpha | 磷酸肌醇3-激酶,调节亚基1(alpha) | FLT-1与p85相互作用。 | 绑定 | 7657594 |
PLCG1 | PLC-II |PLC1 |PLC148 |Plcgamma1 | phospholipase C, gamma 1 | 重构的复合物 Two-hybrid |
Biogrid | 9398617 |
PLCG1 | PLC-II |PLC1 |PLC148 |Plcgamma1 | phospholipase C, gamma 1 | FLT-1与PLC-GAMMA的氨基末端SH2结构域相互作用。 | 绑定 | 9398617 |
PLCG2 | - | 磷脂酶C,伽马2(磷脂酰肌醇特异性) | - | HPRD | 9398617 |
PTPN11 | bptp3 |CFC |MGC14433 |NS1 |PTP-1D |PTP2C |SH-PTP2 |sh-ptp3 |SHP2 | protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 11 | FLT-1与SHP-2的氨基末端SH2结构域相互作用。 | 绑定 | 9600074 |
SHC1 | FLJ26504 |SHC |SHCA | SHC(SRC同源性2结构域)转化蛋白1 | - | HPRD,Biogrid | 10749680 |
SHC2 | SCK |SHCB |sli | SHC(SRC同源性2结构域)转化蛋白2 | Two-hybrid | Biogrid | 10749680 |
VEGFA | MGC70609 |VEGF |VEGF-A |VPF | 血管内皮生长因子A | VEGF165与FLT-1相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的人VEGF165和FLT-1之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 14600159 |
VEGFA | MGC70609 |VEGF |VEGF-A |VPF | 血管内皮生长因子A | VEGF-A与VEGFR-1相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的人VEGF-A和VEGFR-1之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 12810700 |
VEGFA | MGC70609 |VEGF |VEGF-A |VPF | 血管内皮生长因子A | - | HPRD | 8621427 |
VEGFB | VEGFL |VRF | 血管内皮生长因子B | - | HPRD,Biogrid | 9751730 |