概括
基因 23211
象征 ZC3H4
同义词 C19orf7
描述 锌指CCCH型包含4
参考 HGNC:HGNC:17808|Ensembl:ENSG00000130749|Vega:Otthumg00000183442
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19q13.32
Pascal P值 0.095
胎儿β 0.988
DMG 2(#研究)
主持人 伏隔核基底神经节
支持 COMPOSITESET
Darnell FMRP目标
Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Montano_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括CPG与精神分裂症之间的172个复制关联。 2
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG27300045 19 47610813 ZC3H4 3.93E-4 -0.004 0.197 DMG:Montano_2016
CG18489475 19 47617233 ZC3H4 5.296E-4 0.595 0.048 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
BRWD2 0.90 0.91
WDR5 0.88 0.88
Cul4a 0.87 0.89
KDM2A 0.87 0.89
MBTPS1 0.87 0.88
SFRS14 0.87 0.87
pol 0.87 0.89
SEC23IP 0.87 0.88
格恩 0.87 0.88
MCM3AP 0.87 0.87
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.77 -0.80
AF347015.31 -0.77 -0.80
AF347015.21 -0.75 -0.83
FXYD1 -0.73 -0.75
AF347015.27 -0.73 -0.75
mt-cyb -0.73 -0.75
AF347015.8 -0.73 -0.77
AF347015.33 -0.73 -0.74
higd1b -0.73 -0.78
ifi27 -0.71 -0.72

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN 483 336 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nouzova维甲酸和H4乙酰化 143 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线响应集群D2 41 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线高剂量DN 312 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dazard对UV NHEK DN的反应 318 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI假足趋化性DN 457 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由PML Rara Fusion绑定的Martens 456 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因