基因页:ZC3H4
概括?
基因 | 23211 |
象征 | ZC3H4 |
同义词 | C19orf7 |
描述 | 锌指CCCH型包含4 |
参考 | HGNC:HGNC:17808|Ensembl:ENSG00000130749|Vega:Otthumg00000183442 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19q13.32 |
Pascal P值 | 0.095 |
胎儿β | 0.988 |
DMG | 2(#研究) |
主持人 | 伏隔核基底神经节 元 |
支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Montano_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括CPG与精神分裂症之间的172个复制关联。 | 2 |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG27300045 | 19 | 47610813 | ZC3H4 | 3.93E-4 | -0.004 | 0.197 | DMG:Montano_2016 |
CG18489475 | 19 | 47617233 | ZC3H4 | 5.296E-4 | 0.595 | 0.048 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
BRWD2 | 0.90 | 0.91 |
WDR5 | 0.88 | 0.88 |
Cul4a | 0.87 | 0.89 |
KDM2A | 0.87 | 0.89 |
MBTPS1 | 0.87 | 0.88 |
SFRS14 | 0.87 | 0.87 |
pol | 0.87 | 0.89 |
SEC23IP | 0.87 | 0.88 |
格恩 | 0.87 | 0.88 |
MCM3AP | 0.87 | 0.87 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.77 | -0.80 |
AF347015.31 | -0.77 | -0.80 |
AF347015.21 | -0.75 | -0.83 |
FXYD1 | -0.73 | -0.75 |
AF347015.27 | -0.73 | -0.75 |
mt-cyb | -0.73 | -0.75 |
AF347015.8 | -0.73 | -0.77 |
AF347015.33 | -0.73 | -0.74 |
higd1b | -0.73 | -0.78 |
ifi27 | -0.71 | -0.72 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN | 483 | 336 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nouzova维甲酸和H4乙酰化 | 143 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
外邦紫外线响应集群D2 | 41 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
外邦紫外线高剂量DN | 312 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dazard对UV NHEK DN的反应 | 318 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MILI假足趋化性DN | 457 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足型haptotaxis dn | 668 | 419 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由PML Rara Fusion绑定的Martens | 456 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化 | 570 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |