基因页：NUP210

概括？
基因 23225
象征 NUP210
同义词 GP210 | POM210
描述 核孔蛋白210KDA
参考 MIM：607703|HGNC：HGNC：30052|ENSEMBL：ENSG00000132182|HPRD：06368|Vega：Otthumg00000157268
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3P25.1
Pascal P值 0.033
Sherlock P值 0.221
胎儿β 0.755
DMG 1（＃研究）
主持人 小脑半球
小脑
迈尔斯的顺式和跨性别
支持 COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV：GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 1
DNM：Fromer_2014 整个外显子组测序分析 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究，该研究使用基因组DNA报告了DNM。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR：0.006

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 筛 CG46 特征 学习
NUP210 CHR3 13368735 C t NM_024923 p.1497v> i 错过 精神分裂症 DNM：Fromer_2014

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG01562813 3 13420826 NUP210 5.044e-4 0.723 0.047 DMG：Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17036821 CHR3 12533147 NUP210 23225 2.919E-4 顺式
RS7525341 CHR1 39430178 NUP210 23225 0.01 反式
RS2457070 CHR1 48024772 NUP210 23225 0.04 反式
SNP_A-1924461 0 NUP210 23225 0.08 反式
RS12046770 CHR1 100036271 NUP210 23225 0.11 反式
RS17483451 0 NUP210 23225 0.05 反式
RS17565949 CHR1 109527612 NUP210 23225 0.05 反式
RS12564871 CHR1 163771926 NUP210 23225 2.441E-4 反式
RS13374982 CHR1 163772454 NUP210 23225 0.07 反式
RS697455 CHR1 202512075 NUP210 23225 0.01 反式
RS12079530 CHR1 203368216 NUP210 23225 0.06 反式
RS12058586 CHR1 209770437 NUP210 23225 0.06 反式
RS1931329 CHR1 229887908 NUP210 23225 0.01 反式
RS9424509 CHR1 233072174 NUP210 23225 0.01 反式
SNP_A-2273867 0 NUP210 23225 0.02 反式
RS6430976 CHR2 128822384 NUP210 23225 2.12e-10 反式
RS11684252 CHR2 128829365 NUP210 23225 4.381E-6 反式
RS16829545 CHR2 151977407 NUP210 23225 9.324e-13 反式
RS193602 CHR2 202677291 NUP210 23225 0.01 反式
RS7585095 CHR2 202687013 NUP210 23225 0.01 反式
RS1030289 CHR2 208326655 NUP210 23225 0.04 反式
RS16866455 CHR2 225871746 NUP210 23225 0.01 反式
RS31276 CHR2 229920519 NUP210 23225 0.08 反式
RS17036821 CHR3 12533147 NUP210 23225 0.03 反式
RS1816996 CHR3 30007104 NUP210 23225 0.07 反式
RS13317986 CHR3 84720981 NUP210 23225 0.01 反式
RS16851413 CHR3 105380523 NUP210 23225 0.16 反式
RS4680661 CHR3 165505524 NUP210 23225 0.17 反式
RS6766336 CHR3 171320906 NUP210 23225 0.09 反式
RS16831155 CHR3 173574763 NUP210 23225 0 反式
RS16860219 CHR3 185493589 NUP210 23225 0 反式
RS2885550 CHR3 190457297 NUP210 23225 0.2 反式
RS4368678 CHR4 6712461 NUP210 23225 0.13 反式
RS10030508 CHR4 38939115 NUP210 23225 0.07 反式
SNP_A-4206824 0 NUP210 23225 0.08 反式
RS17000340 CHR4 76135365 NUP210 23225 0.1 反式
RS17004874 CHR4 81214574 NUP210 23225 2.621e-11 反式
RS4349595 CHR4 82517335 NUP210 23225 0.02 反式
RS17017846 CHR4 91898937 NUP210 23225 0.06 反式
RS17034289 CHR4 157174337 NUP210 23225 0.17 反式
RS17036588 CHR4 158561487 NUP210 23225 1.065E-8 反式
RS715658 CHR4 168851620 NUP210 23225 0.01 反式
RS7655225 CHR4 170265627 NUP210 23225 0.09 反式
RS7730772 CHR5 87445192 NUP210 23225 0.06 反式
RS11949627 CHR5 100746396 NUP210 23225 0.14 反式
RS7728190 CHR5 126593184 NUP210 23225 0.09 反式
RS11957269 CHR5 126618120 NUP210 23225 0.09 反式
RS1366150 CHR5 162627643 NUP210 23225 0.14 反式
RS17064998 0 NUP210 23225 0 反式
RS4976671 CHR5 176476197 NUP210 23225 5.31E-5 反式
RS17629180 CHR6 34285608 NUP210 23225 0.1 反式
RS17696583 CHR6 34291764 NUP210 23225 0.09 反式
RS4713782 CHR6 34401280 NUP210 23225 0.08 反式
RS802177 CHR6 70876920 NUP210 23225 0.04 反式
RS3734661 CHR6 90651149 NUP210 23225 0.09 反式
RS16883826 CHR6 91671158 NUP210 23225 0.01 反式
RS9342378 CHR6 94468892 NUP210 23225 0.14 反式
RS17067643 CHR6 138791793 NUP210 23225 0.17 反式
RS17138193 CHR7 7848940 NUP210 23225 0.01 反式
RS1440240 CHR7 9244624 NUP210 23225 0.17 反式
RS7778042 CHR7 29637891 NUP210 23225 0.04 反式
RS2286155 CHR7 50827937 NUP210 23225 0.15 反式
SNP_A-2189492 0 NUP210 23225 0.19 反式
RS17348162 CHR8 4672579 NUP210 23225 0.01 反式
RS2720589 CHR8 17467802 NUP210 23225 0.06 反式
RS7838790 CHR8 78334984 NUP210 23225 0.05 反式
RS2449539 CHR8 98847254 NUP210 23225 0.05 反式
RS2512062 CHR8 98847718 NUP210 23225 0.05 反式
RS17722245 Chr9 1070774 NUP210 23225 0.04 反式
RS17618655 Chr9 73983104 NUP210 23225 3.584e-11 反式
RS11255704 Chr10 8501820 NUP210 23225 0 反式
RS12268320 Chr10 19362282 NUP210 23225 0.04 反式
RS1539322 Chr10 22705774 NUP210 23225 0.08 反式
RS4748908 Chr10 24014121 NUP210 23225 0.08 反式
RS703018 Chr10 28621506 NUP210 23225 0.04 反式
RS1262024 Chr10 28634645 NUP210 23225 0.17 反式
RS1763437 Chr10 29271860 NUP210 23225 0.05 反式
RS4934985 Chr10 33905260 NUP210 23225 5.244e-9 反式
RS12219173 Chr10 68689566 NUP210 23225 0.19 反式
RS2574789 Chr10 78851341 NUP210 23225 0.09 反式
RS17808274 Chr10 107531368 NUP210 23225 0 反式
RS822330 Chr10 108913661 NUP210 23225 0.01 反式
RS7928511 Chr11 41805700 NUP210 23225 0.09 反式
RS2276020 Chr11 67257555 NUP210 23225 2.664E-4 反式
RS2156215 Chr11 78825462 NUP210 23225 0 反式
RS2198255 Chr11 80187110 NUP210 23225 0.1 反式
RS17311479 Chr11 80190209 NUP210 23225 0.1 反式
RS509027 Chr11 109200795 NUP210 23225 0 反式
RS11214244 Chr11 112434429 NUP210 23225 0.02 反式
RS9633948 Chr11 119731209 NUP210 23225 0.06 反式
RS470876 Chr11 120013306 NUP210 23225 0.07 反式
RS10491959 CHR12 1788032 NUP210 23225 0.01 反式
RS4148663 CHR12 22035614 NUP210 23225 0.01 反式
RS7953173 CHR12 44488755 NUP210 23225 8.632e-5 反式
RS10876176 CHR12 51811831 NUP210 23225 0.08 反式
RS1493193 CHR12 51906348 NUP210 23225 0.08 反式
RS7302923 CHR12 51916585 NUP210 23225 0.08 反式
RS11115141 CHR12 82382176 NUP210 23225 0.06 反式
RS11115761 CHR12 83764788 NUP210 23225 0.15 反式
RS11115842 CHR12 83828875 NUP210 23225 0.15 反式
RS11115868 CHR12 83845663 NUP210 23225 0.15 反式
RS960333 CHR12 114550809 NUP210 23225 0.16 反式
RS17089379 CHR13 64433308 NUP210 23225 0.02 反式
RS6574911 CHR14 26806521 NUP210 23225 0.19 反式
RS1253651 CHR14 52428425 NUP210 23225 0.17 反式
RS998650 CHR14 66640006 NUP210 23225 0.05 反式
RS2146229 CHR14 67775691 NUP210 23225 0.04 反式
RS12589306 CHR14 74881306 NUP210 23225 0.19 反式
RS10467741 CHR14 83585040 NUP210 23225 1.209E-8 反式
RS234148 CHR14 98155018 NUP210 23225 0.11 反式
RS17115060 CHR15 25279861 NUP210 23225 0.09 反式
RS782949 CHR15 61344246 NUP210 23225 0.16 反式
SNP_A-4228996 0 NUP210 23225 0.06 反式
RS11873184 CHR18 1584081 NUP210 23225 0.03 反式
RS16952078 CHR18 7531387 NUP210 23225 7.212E-4 反式
RS2333639 CHR18 64530563 NUP210 23225 0.14 反式
RS8107683 CHR19 35901140 NUP210 23225 0.09 反式
RS6032295 CHR20 44178138 NUP210 23225 0.01 反式
RS8126261 CHR20 53146240 NUP210 23225 4.091E-5 反式
RS6098196 CHR20 53340365 NUP210 23225 0.19 反式
RS1412196 CHR20 58675024 NUP210 23225 0.19 反式
RS6513478 CHR20 58676660 NUP210 23225 0 反式
RS6092877 CHR20 58712456 NUP210 23225 0 反式
RS1344430 CHR20 60099390 NUP210 23225 0.15 反式
RS915529 CHR21 33726325 NUP210 23225 0.03 反式
RS135346 CHR22 48409540 NUP210 23225 0.01 反式
RS5943566 Chrx 28401493 NUP210 23225 0.19 反式
RS6652005 0 NUP210 23225 7.845e-4 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005515 蛋白质结合 IPI 15231747
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0051028 mRNA运输 IEA -
去：0015031 蛋白质运输 IEA -
去：0065002 细胞内蛋白跨膜转运 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005789 内质网膜 IEA -
去：0005634 核 IEA -
去：0005643 核孔 IEA -
去：0005783 内质网 IEA -
去：0016020 膜 IEA -
GO：0016021 膜不可或缺 IEA -
GO：0031965 核膜 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
非编码RNA的反应组代谢 49 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IFN刺激基因的反应组抗病毒机制 66 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
含有前mRNA的封顶内含子的反应组处理 140 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
成熟转录本向细胞质的反应组传输 54 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
小分子的反应组跨膜转运 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome mRNA处理 161 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
源自内在转录本的成熟mRNA的反应组传输 33 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SLC介导的跨膜运输 241 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome葡萄糖转运 38 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
READEM RNA的代谢 330 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome干扰素信号传导 159 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
碳水化合物的反应组代谢 247 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome流感生命周期 203 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome NEP NS2与细胞出口机械相互作用 27 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome HIV感染 207 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
核糖核蛋白转运到宿主核的反应组转运 27 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome HIV生命周期 125 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome宿主的艾滋病毒因素的相互作用 132 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome HIV生命周期的后期 104 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VPR与宿主细胞蛋白的反应组相互作用 33 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄糖激酶调节蛋白对葡萄糖激酶的反应组调节 27 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 270 204 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chemnitz对前列腺素E2的反应 146 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标 473 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Slebos头和颈癌与HPV 84 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan mll签名1 380 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 UP 418 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mattioli Mgus vs PCL 116 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser MYC靶向血清抑制 159 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mohankumar TLX1靶向 414 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC网络 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEI mir34a目标 148 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1定位DN的Alcalay AML 184 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN 287 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向DN 292 189 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 281 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦凯布（McCabe）由HOXC6绑定 469 239 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mitsiades对aplidin DN的反应 249 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir34b和Mir34C的丰田目标 463 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee区分T淋巴细胞 200 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌的生存率差A6 456 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带8 21易位 368 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PYEON CANCAR CANCAR HEAD和NECK与颈椎 193 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由PML Rara Fusion绑定的Martens 456 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Acosta增殖独立MYC靶向 84 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向DN 553 343 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过p38完成的phong TNF响应 227 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞DN 428 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-125/351 399 406 1A，M8 HSA-MIR-125B脑 ucccugagacccuaacuuguga
HSA-MIR-125A脑 ucccugagacccuuaaccugug