基因页：SEL1L3

概括？
基因 23231
象征 SEL1L3
同义词 SEL-1L3
描述 SEL1L家庭成员3
参考 HGNC：HGNC：29108|Ensembl：ENSG0000000091490|HPRD：11105|Vega：Otthumg00000160331
基因类型 蛋白质编码
地图位置 4P15.2
Pascal P值 0.021
Sherlock P值 0.171
胎儿β 0.144
主持人 小脑
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
简历：Phewas 全球整个关联研究（PHEWAS） 157个与精神分裂症相关的SNP 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历：Phewas

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离
RS959903 4 25810096 无效的 1.541 SEL1L3 无效的

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
SNP_A-4290143 0 SEL1L3 23231 0.07 反式
RS16829545 CHR2 151977407 SEL1L3 23231 1.48e-13 反式
RS3747518 CHR2 163128724 SEL1L3 23231 0.15 反式
RS3845734 CHR2 171125572 SEL1L3 23231 0 反式
RS7584986 CHR2 184111432 SEL1L3 23231 1.101E-7 反式
RS16889812 CHR4 14195043 SEL1L3 23231 0.19 反式
RS16889813 CHR4 14196540 SEL1L3 23231 0.05 反式
RS2183142 CHR4 159232695 SEL1L3 23231 0 反式
RS337984 CHR4 173411662 SEL1L3 23231 0.15 反式
RS3111196 CHR5 54402889 SEL1L3 23231 0.02 反式
RS1380396 CHR5 100737044 SEL1L3 23231 0.08 反式
RS6887062 CHR5 123850762 SEL1L3 23231 0.03 反式
RS327867 CHR5 125217366 SEL1L3 23231 0.14 反式
RS9461864 CHR6 33481468 SEL1L3 23231 0 反式
RS16890367 CHR6 38078448 SEL1L3 23231 0.1 反式
RS7794215 CHR7 11477363 SEL1L3 23231 0.18 反式
RS3118341 Chr9 25185518 SEL1L3 23231 0.03 反式
RS2225105 Chr9 25480908 SEL1L3 23231 0.15 反式
RS16955618 CHR15 29937543 SEL1L3 23231 7.665e-18 反式
RS17540498 CHR15 93800424 SEL1L3 23231 0.12 反式
RS11882889 CHR19 19887684 SEL1L3 23231 0.01 反式
RS1041786 CHR21 22617710 SEL1L3 23231 0 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
rere 0.94 0.96
BAT2 0.94 0.95
PRR12 0.92 0.95
setd1a 0.92 0.94
ATXN2L 0.92 0.94
Smarcc2 0.92 0.93
SRCAP 0.92 0.95
ZC3H18 0.91 0.92
SF3A1 0.91 0.91
KHSRP 0.91 0.91
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.76 -0.83
higd1b -0.74 -0.83
MT-CO2 -0.73 -0.82
FXYD1 -0.73 -0.79
S100B -0.72 -0.79
ifi27 -0.70 -0.77
PSMB9 -0.70 -0.76
B2M -0.70 -0.75
COPZ2 -0.70 -0.75
AF347015.33 -0.70 -0.75

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005488 捆绑 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0016020 膜 IEA -
GO：0016021 膜不可或缺 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
渡边直肠癌放疗反应能力 108 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn 493 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chemnitz对前列腺素E2 DN的反应 391 222 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Davicioni分子臂与ERMS 332 228 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Deurig t细胞促进性白血病DN 320 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础DN 455 304 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗伊伤口血管向上 50 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
莱茵所有糖皮质激素治疗 78 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1突变签名1向上 276 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan mll签名1 380 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 UP 418 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1签名3 341 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
帕帕斯帕斯帕贝多诺斯不稳定的动脉粥样硬化斑块 52 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tien肠益生菌2小时 27 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tien肠益生菌6小时 55 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tien肠益生菌24小时DN 214 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌 443 294 该途径中的所有SZGR 2.0基因
环氧化物素的浓凋亡 239 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KAN对砷三氧化物的反应 123 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与基础 330 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YANG乳腺癌ESR1激光DN 50 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM2 153 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
唱歌转移基质 110 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2 DN 464 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
克莱因原发性积液淋巴瘤DN 58 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu IL4信号传导 94 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭雷帕霉素的反应 203 130 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLI1融合的Zhang目标 88 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Traynor Rett综合征DN 19 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏 487 303 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang Smarce1靶向 280 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦克拉克兰牙科龋齿 253 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时的反应 953 554 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat的反应24小时 783 442 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID乳腺癌腔B DN 564 326 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌正常 476 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bernard PPAPDC1B目标DN 58 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌良好生存A12 317 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌肉DN中的罗马胰岛素靶标 204 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Valk AML群集15 31 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
cebpa的valk aml 37 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G5 DN 27 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌子类CTNNB1 DN 170 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类增殖 178 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML与11q23重新排列 351 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Noushmehr GBM被甲基化沉默 50 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1靶向衰老 572 352 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang对GSK3抑制剂SB216763 DN的响应 374 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoelzel NF1靶向 139 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标2 UP 140 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-145 107 113 M8 HSA-MIR-145 guccaguuucccaggaaucccuu
mir-185 16 23 1A，M8 HSA-MIR-185脑 Uggagaaaggcaguuc
mir-30-5p 568 574 1a HSA-MIR-30A-5P uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C脑 uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ uguaaacauccccgacuggaag
HSA-MIR-30BSZ uguaaacauccuaccucucagcu
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga