基因页:PACS2
概括?
基因 | 23241 |
象征 | PACS2 |
同义词 | PACS-2 | PACS1L |
描述 | 磷酸素酸性簇排序蛋白2 |
参考 | MIM:610423|HGNC:HGNC:23794|ENSEMBL:ENSG00000179364|HPRD:17816|Vega:Otthumg00000170450 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 14Q32.33 |
Pascal P值 | 0.118 |
胎儿β | 0.347 |
DMG | 2(#研究) |
支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Montano_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括CPG与精神分裂症之间的172个复制关联。 | 2 |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG19769147 | 14 | 105860954 | PACS2 | 3.08e-6 | 0.009 | 0.024 | DMG:Montano_2016 |
CG06937357 | 14 | 105837270 | PACS2 | 7.1e-5 | -0.431 | 0.025 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PACS2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
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刘cmyb靶向 | 165 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delaserna Myod的目标 | 89 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lein少突胶质细胞 | 74 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |