基因页面:KIAA0556
总结吗?
GeneID | 23247年 |
象征 | KIAA0556 |
同义词 | JBTS26 |
描述 | KIAA0556 |
参考 | MIM: 616650|HGNC: HGNC: 29068|运用:ENSG00000047578|HPRD: 13806|织女:OTTHUMG00000176780 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 16 p12.1 |
帕斯卡假定值 | 0.016 |
夏洛克假定值 | 0.521 |
胎儿β | -0.026 |
DMG | 1(#研究) |
支持 | Ascano FMRP目标 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 2 |
GSMA_IIE | 基因组扫描荟萃分析(欧洲血统的样品) | Psr: 0.01775 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg07025312 | 16 | 27583843 | KIAA0556 | 1.727的军医 | -0.576 | 0.033 | DMG: Wockner_2014 |
cg02314514 | 16 | 27786318 | KIAA0556 | 4.512的军医 | 0.328 | 0.045 | DMG: Wockner_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/KIAA0556_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ZBTB7A | 0.94 | 0.93 |
PHF15 | 0.94 | 0.91 |
微软目前 | 0.93 | 0.90 |
HLF | 0.92 | 0.89 |
HABP4 | 0.91 | 0.89 |
ZNF365 | 0.90 | 0.82 |
MBNL2 | 0.90 | 0.85 |
PPP1R16B | 0.90 | 0.82 |
IQSEC1 | 0.90 | 0.79 |
SYNPO | 0.90 | 0.89 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
BCL7C | -0.59 | -0.73 |
C9orf46 | -0.57 | -0.74 |
TUBB2B | -0.57 | -0.65 |
TRAF4 | -0.57 | -0.70 |
DYNLT1 | -0.56 | -0.79 |
KIAA1949 | -0.56 | -0.54 |
EXOSC8 | -0.55 | -0.68 |
RPL23A | -0.55 | -0.71 |
YBX1 | -0.55 | -0.62 |
GTF3C6 | -0.54 | -0.62 |
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005179 | 激素的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0005576 | 细胞外区域 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
父母MTOR信号了 | 567年 | 375年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DAVICIONI分子武器VS erm | 332年 | 228年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CHARAFE乳腺癌导管和基地 | 380年 | 215年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CHARAFE乳腺癌细胞腔的VS间充质 | 450年 | 256年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
多德鼻咽癌起来 | 1821年 | 933年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
魏MYCN目标与E箱 | 795年 | 478年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
李PTCH1和SUFU的目标 | 53 | 37 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ACEVEDO肝癌了 | 973年 | 570年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ACEVEDO肝脏肿瘤与邻近正常组织 | 863年 | 514年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
结肠癌年级了 | 871年 | 505年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
菲格罗亚AML甲基化集群3 | 170年 | 97年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
促进DN KDM1A目标 | 211年 | 119年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |