概括
基因 23256
象征 SCFD1
同义词 c14orf163 | ra410 | sly1 | sly1p | stxbp1l2
描述 Sec1家族域包含1
参考 HGNC:HGNC:20726|Ensembl:ENSG00000092108|HPRD:10210|Vega:Otthumg00000029420
基因类型 蛋白质编码
地图位置 14Q12
Pascal P值 0.193
Sherlock P值 0.044
胎儿β 1.322
主持人 小脑半球
小脑
支持 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSUS
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.047

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006904 囊肿囊肿的囊泡对接 IEA -
GO:0016192 囊泡介导的运输 IEA -
去:0015031 蛋白质运输 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005794 高尔基体 IEA -
去:0005789 内质网膜 IEA -
去:0005634 艾达 18029348
去:0005730 核仁 艾达 18029348
去:0005737 细胞质 IEA -
去:0005783 内质网 IEA -
去:0016020 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
hahtola兄弟姐妹Fungoides皮肤DN 27 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞DN 485 334 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLI1和DAX1 DN的Garcia目标 176 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shen Smarca2目标 424 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard对UV SCC的反应 123 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
H3K27ME3 DN的Acevedo肝癌 228 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bernard PPAPDC1B目标 40 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对Salirasib的反应 245 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura MAPK8目标DN 366 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aguirre胰腺癌复制号 298 174 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI假足趋化性DN 457 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-496 45 51 1a HSA-MIR-496 Auuacauggccaaucuc