基因页：MCF2L

Summary？
基因 23263
象征 MCF2L
同义词 arhgef14 | dbs | ost
描述 MCF.2细胞系导出的转换序列
参考 MIM：609499|HGNC：HGNC：14576|ENSEMBL：ENSG00000126217|HPRD：14371|Vega：Otthumg0000000017377
基因类型 蛋白质编码
地图位置 13q34
Pascal P值 0.363
DEG P值 DEG：Maycox_2009：cc_ba10_fold_change = 1.23：cc_ba10_disease_p = 0.0416：hbb_ba9_fold_change = 1.22：hbb_ba9_disease_p = 0.0309
DMG 1（＃研究）
主持人 小脑半球
小脑
海马
梭子基底神经节

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DEG：Maycox_2009 微阵列确定验尸后30000多个mRNA转录本的表达 我们包括了51个基因，其表达变化在两个精神分裂症队列之间很常见。
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 4

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG16564828 13 113660298 MCF2L 2.46E-6 0.769 0.008 DMG：Wockner_2014
CG19028462 13 113677628 MCF2L 2.7e-5 -0.821 0.018 DMG：Wockner_2014
CG04024481 13 113752435 MCF2L 5.94e-5 0.391 0.023 DMG：Wockner_2014
CG26682407 13 113660246 MCF2L 1.51E-4 0.564 0.032 DMG：Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS3011518 13 113676258 MCF2L ENSG00000126217.16 2.648e-8 0 127566 gtex_brain_putamen_basal
RS3011517 13 113676795 MCF2L ENSG00000126217.16 1.556E-8 0 128103 gtex_brain_putamen_basal
RS3011516 13 113676801 MCF2L ENSG00000126217.16 1.549E-8 0 128109 gtex_brain_putamen_basal
RS2993304 13 113677170 MCF2L ENSG00000126217.16 1.305E-8 0 128478 gtex_brain_putamen_basal
RS2993307 13 113680999 MCF2L ENSG00000126217.16 2.13e-8 0 132307 gtex_brain_putamen_basal
RS2993309 13 113682246 MCF2L ENSG00000126217.16 6.883E-10 0 133554 gtex_brain_putamen_basal
RS2993310 13 113682788 MCF2L ENSG00000126217.16 7.509E-10 0 134096 gtex_brain_putamen_basal
RS2993311 13 113683045 MCF2L ENSG00000126217.16 2.872E-7 0 134353 gtex_brain_putamen_basal
RS2993313 13 113684467 MCF2L ENSG00000126217.16 2.582E-9 0 135775 gtex_brain_putamen_basal
RS2993314 13 113685128 MCF2L ENSG00000126217.16 2.781E-8 0 136436 gtex_brain_putamen_basal
RS67050717 13 113685550 MCF2L ENSG00000126217.16 8.797E-9 0 136858 gtex_brain_putamen_basal
RS2993315 13 113685654 MCF2L ENSG00000126217.16 2.662E-8 0 136962 gtex_brain_putamen_basal
RS3011510 13 113686025 MCF2L ENSG00000126217.16 8.827E-8 0 137333 gtex_brain_putamen_basal
RS3011509 13 113686209 MCF2L ENSG00000126217.16 2.761E-8 0 137517 gtex_brain_putamen_basal
RS2993317 13 113687143 MCF2L ENSG00000126217.16 2.796E-8 0 138451 gtex_brain_putamen_basal
RS2993319 13 113687405 MCF2L ENSG00000126217.16 6.298E-8 0 138713 gtex_brain_putamen_basal
RS2993321 13 113687950 MCF2L ENSG00000126217.16 2.761E-8 0 139258 gtex_brain_putamen_basal
RS3011506 13 113688269 MCF2L ENSG00000126217.16 2.761E-8 0 139577 gtex_brain_putamen_basal
RS2993322 13 113688711 MCF2L ENSG00000126217.16 2.936E-8 0 140019 gtex_brain_putamen_basal
RS28464357 13 113688862 MCF2L ENSG00000126217.16 2.744e-8 0 140170 gtex_brain_putamen_basal
RS3011505 13 113691083 MCF2L ENSG00000126217.16 2.476E-9 0 142391 gtex_brain_putamen_basal
RS4907576 13 113692063 MCF2L ENSG00000126217.16 1.497E-9 0 143371 gtex_brain_putamen_basal
RS1537024 13 113696472 MCF2L ENSG00000126217.16 6.934e-9 0 147780 gtex_brain_putamen_basal
RS7984552 13 113697854 MCF2L ENSG00000126217.16 6.291e-11 0 149162 gtex_brain_putamen_basal
rs7330238 13 113703404 MCF2L ENSG00000126217.16 4.471E-9 0 154712 gtex_brain_putamen_basal
。 13 113704590 MCF2L ENSG00000126217.16 2.024e-9 0 155898 gtex_brain_putamen_basal
RS373809009 13 113705588 MCF2L ENSG00000126217.16 5.631E-7 0 156896 gtex_brain_putamen_basal
RS4907579 13 113706415 MCF2L ENSG00000126217.16 4.781e-11 0 157723 gtex_brain_putamen_basal
RS7337434 13 113707867 MCF2L ENSG00000126217.16 5.951e-11 0 159175 gtex_brain_putamen_basal
RS7328336 13 113712706 MCF2L ENSG00000126217.16 5.865e-11 0 164014 gtex_brain_putamen_basal
RS28589473 13 113713101 MCF2L ENSG00000126217.16 2.359E-8 0 164409 gtex_brain_putamen_basal
RS6577026 13 113713671 MCF2L ENSG00000126217.16 2.345e-8 0 164979 gtex_brain_putamen_basal
RS4907581 13 113713905 MCF2L ENSG00000126217.16 2.37E-8 0 165213 gtex_brain_putamen_basal
RS9549650 13 113715787 MCF2L ENSG00000126217.16 7.995e-12 0 167095 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
KIAA0317 0.88 0.91
kif3c 0.88 0.92
C6orf168 0.87 0.90
PNMA1 0.87 0.90
SH3BP5L 0.87 0.91
SLC8A3 0.87 0.90
KLHL18 0.87 0.91
mapt 0.87 0.93
PCDHAC1 0.86 0.91
MSL1 0.86 0.89
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.76 -0.80
MT-CO2 -0.75 -0.80
AF347015.33 -0.74 -0.77
FXYD1 -0.74 -0.77
AC021016.1 -0.73 -0.81
AF347015.27 -0.73 -0.78
mt-cyb -0.73 -0.78
AF347015.8 -0.72 -0.79
COPZ2 -0.71 -0.76
S100B -0.70 -0.75

部分诉通路注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
pid rhoa reg途径 46 30 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID CDC42 REG PATHWAY 30 22 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID TRKR途径 62 48 All SZGR 2.0 genes in this pathway
乳腺癌腔与间充质 450 256 All SZGR 2.0 genes in this pathway
vecchi胃癌早期 430 232 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mullighan MLL签名1 DN 242 165 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mullighan MLL签名2 DN 281 186 All SZGR 2.0 genes in this pathway
周的炎症反应fima 544 308 All SZGR 2.0 genes in this pathway
周INFLAMMATORY RESPONSE LPS UP 431 237 All SZGR 2.0 genes in this pathway
多德鼻咽癌 1821年 933 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Perez TP53目标 1174 695 All SZGR 2.0 genes in this pathway
农民乳腺癌根源与腔内 326 213 All SZGR 2.0 genes in this pathway
taghavi肿瘤转化 12 10 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Amit EGF响应120 HELA 69 47 All SZGR 2.0 genes in this pathway
XU GH1自分泌目标DN 142 94 All SZGR 2.0 genes in this pathway
促进耐受巨噬细胞DN 409 268 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mitsiades对aplidin的反应 439 257 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Smid乳腺癌基础DN 701 446 All SZGR 2.0 genes in this pathway
级结肠癌 871 505 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boquest干细胞DN 216 143 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS UP 1305 895 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Jison Sickle细胞疾病DN 181 97 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SENGUPTA EBNA1 ANTICORRELATED 173 85 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Smad1和Smad5抑制Pangas肿瘤 134 85 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Plasari TGFB1通过NFIC 10HR DN信号传导 30 25 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Fortschegger PHF8靶向 279 155 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 All SZGR 2.0 genes in this pathway