基因页:ZC3H7B
概括?
基因 | 23264 |
象征 | ZC3H7B |
同义词 | 罗克森 |
描述 | 锌指CCCH型含有7B |
参考 | HGNC:HGNC:30869|ENSEMBL:ENSG00000100403|HPRD:06711|Vega:Otthumg00000150969 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 22q13.2 |
Pascal P值 | 1.881E-4 |
胎儿β | 0.335 |
DMG | 1(#研究) |
支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG05508875 | 22 | 41697415 | ZC3H7B | 3.46e-10 | -0.018 | 7.22E-7 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ZC3H7B_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
sec61a1 | 0.91 | 0.90 |
sepn1 | 0.91 | 0.87 |
ankfy1 | 0.91 | 0.89 |
ZXDC | 0.90 | 0.90 |
dag1 | 0.90 | 0.90 |
ACOX1 | 0.90 | 0.89 |
HeaTr6 | 0.90 | 0.88 |
C10ORF26 | 0.90 | 0.90 |
VEZF1 | 0.90 | 0.87 |
MTMR3 | 0.90 | 0.90 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.66 | -0.78 |
C5orf53 | -0.65 | -0.70 |
AF347015.31 | -0.65 | -0.76 |
AF347015.27 | -0.64 | -0.75 |
AF347015.33 | -0.63 | -0.73 |
AF347015.8 | -0.63 | -0.76 |
AF347015.21 | -0.62 | -0.81 |
mt-cyb | -0.62 | -0.73 |
FXYD1 | -0.61 | -0.70 |
S100B | -0.60 | -0.68 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
周的炎症反应生活 | 485 | 293 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gal白血病干细胞向上 | 133 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ginestier乳腺癌Znf217扩增DN | 335 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘普通癌基因 | 79 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病初期 | 390 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
螺旋吸烟者肺癌DN | 22 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee区分T淋巴细胞 | 200 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |