Summary
基因ID 23286
Symbol WWC1
同义词 hbebp3 | hbebp36 | kibra | memryqtl | ppp1r168
描述 WW和C2域包含1
参考 MIM:610533|HGNC:HGNC:29435|ENSEMBL:ENSG00000113645|HPRD:10033|Vega:Otthumg00000130408
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5Q34
Pascal P值 0.175
Sherlock P值 0.013
胎儿β 0.469
主持人
支持 CompositeSet
Darnell FMRP目标
Ascano FMRP目标
潜在的突触基因

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
gsma_iie Genome scan meta-analysis (European-ancestry samples) PSR:0.01718
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) Psr: 0.00459
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.0276
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
网络 最短路径距离核心基因在人类protein-protein interaction network PPI网络中最短路径的贡献:0.0762

Section I. Genetics and epigenetics annotation


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
RFK 0.79 0.84
TCEAL1 0.77 0.80
RNF11 0.76 0.83
Gabra5 0.76 0.81
UPP2 0.75 0.75
MOCS2 0.75 0.73
ARF3 0.74 0.82
arl6 0.73 0.79
SNX3 0.73 0.70
AMN1 0.73 0.78
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Sorbs3 -0.44 -0.46
AF347015.18 -0.41 -0.37
NSBP1 -0.40 -0.47
AC010618.2 -0.40 -0.39
AC069281.3 -0.39 -0.44
Arhgef1 -0.39 -0.38
micall2 -0.39 -0.40
SLC27A1 -0.38 -0.36
AC098691.2 -0.38 -0.41
PLXNB1 -0.38 -0.40

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005737 cytoplasm IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
河马的Reactome信号传导 22 15 All SZGR 2.0 genes in this pathway
GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn 493 298 All SZGR 2.0 genes in this pathway
周的炎症反应生活 485 293 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Doane对雄激素的反应 184 125 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Basaki YBX1靶向 290 177 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Senese HDAC1和HDAC2靶向 238 144 All SZGR 2.0 genes in this pathway
周的炎症反应fima 544 308 All SZGR 2.0 genes in this pathway
周炎性反应lps up 431 237 All SZGR 2.0 genes in this pathway
多德鼻咽癌 1821年 933 All SZGR 2.0 genes in this pathway
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN 805 505 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gozgit ESR1靶向 149 84 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LANDIS BREAST CANCER PROGRESSION UP 44 27 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Landis Erbb2乳腺肿瘤324向上 150 93 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MCBRYAN PUBERTAL BREAST 3 4WK UP 214 144 All SZGR 2.0 genes in this pathway
McBryan Pubertal乳房4 5WK 271 175 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Rashi对电离辐射3的响应3 48 31 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LUI THYROID CANCER CLUSTER 2 42 31 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 COMMON DN 483 336 All SZGR 2.0 genes in this pathway
王HCP前列腺癌 111 69 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Buytaert光动力疗法应力DN 637 377 All SZGR 2.0 genes in this pathway
洛佩兹MBD目标 957 597 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SCHAEFFER PROSTATE DEVELOPMENT 6HR DN 514 330 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Onder CDH1目标2 DN 464 276 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Frasor对雌二醇的反应 37 28 All SZGR 2.0 genes in this pathway
GERY CEBP目标 126 90 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Browne HCMV感染20小时 240 152 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Yamazaki TCEB3靶向DN 215 132 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dazard对UV NHEK DN的反应 318 220 All SZGR 2.0 genes in this pathway
dazard UV响应集群G6 153 112 All SZGR 2.0 genes in this pathway
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)瞄准 388 234 All SZGR 2.0 genes in this pathway
马丁内斯RB1靶向 673 430 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez TP53目标DN 593 372 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez RB1和TP53靶向DN 591 366 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Massarweh tamoxifen抗性 578 341 All SZGR 2.0 genes in this pathway
mirlet7a3的Brueckner目标 111 69 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Yauch刺猬信号传导旁分泌DN 264 159 All SZGR 2.0 genes in this pathway
清肝癌子类CTNNB1 DN 170 105 All SZGR 2.0 genes in this pathway
清肝癌亚类未经注释 85 50 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Stein Esrra目标 535 325 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kyng正常老化DN 30 13 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kyng Werner综合征DN 29 14 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YAO对孕酮簇5的时间反应5 30 22 All SZGR 2.0 genes in this pathway
惠特菲尔德细胞周期M G1 148 95 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pilon KLF1靶向 504 321 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的 211 131 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 281 183 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Johnstone Parvb目标2 UP 140 94 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KOINUMA TARGETS OF SMAD2 OR SMAD3 824 528 All SZGR 2.0 genes in this pathway
通过p38部分的phong TNF响应 160 106 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Durand Stroma ns 162 103 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zwang 3类由EGF瞬时诱导 222 159 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
miR-138 221 227 1a HSA-MIR-138 Agcugguuguguugaauc
mir-155 224 231 1A,M8 HSA-MIR-155 uuaaugcuaaucgugauagggg
mir-25/32/92/363/367 380 386 1a HSA-MIR-25 Cauugcacuugucucggucuga
HSA-MIR-32 uauugcacauacuaaguugc
HSA-MIR-92 uauugcacuugucccgcgcug
HSA-MIR-367 AAUUGCACUUUAGCAAUGGUGA
HSA-MIR-92BSZ uauugcacucgucccgcgcuc
mir-381 242 248 1a HSA-MIR-381 uauacaagggcaagcucucugu
HSA-MIR-381 uauacaagggcaagcucucugu