基因页面:ANKS1A
总结吗?
| GeneID | 23294年 |
| 象征 | ANKS1A |
| 同义词 | ANKS1 |
| 描述 | 锚蛋白重复包含1和无菌α主题域 |
| 参考 | MIM: 608994|HGNC: HGNC: 20961|运用:ENSG00000064999|HPRD: 10610|织女:OTTHUMG00000014559 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 6 p21.31 |
| 帕斯卡假定值 | 0.028 |
| 夏洛克假定值 | 0.053 |
| eGene | 皮质 元 |
| 支持 | Ascano FMRP目标 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 2 |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.033 | |
| GSMA_IIE | 基因组扫描荟萃分析(欧洲血统的样品) | Psr: 0.04433 | |
| 网络 | 最短路径距离核心基因在人类蛋白质相互作用网络 | 贡献在PPI网络最短路径:0.0156 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
认为表| 基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ANKS1A | chr6 | 34952962 | G | T | NM_015245 | 。 | 沉默 | 精神分裂症 | 认为:Fromer_2014 |
不同甲基化基因
| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg13028789 | 6 | 34856920 | ANKS1A; TAF11 | 5.64 e-5 | -0.372 | 0.022 | DMG: Wockner_2014 |
| cg00215801 | 6 | 34855797 | TAF11; ANKS1A | 6.94 e-5 | -0.332 | 0.024 | DMG: Wockner_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 17353931 | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005737 | 细胞质 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| DAVICIONI分子武器VS erm | 332年 | 228年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CASORELLI急性早幼粒细胞白血病 | 177年 | 110年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 罗德里格斯甲状腺癌分化不良DN | 805年 | 505年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过ERCC3 DN滑落紫外线反应 | 855年 | 609年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 滑落紫外线反应通过ERCC3常见的DN | 483年 | 336年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MAGRANGEAS多发性骨髓瘤IGLL VS IGLK DN | 24 | 18 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 佩特洛娃内皮淋巴和血液 | 131年 | 87年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 道格拉斯BMI1 DN的目标 | 314年 | 188年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CREIGHTON内分泌治疗抵抗2 | 473年 | 224年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李转移和可变剪接 | 74年 | 51 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 里奇尤因肉瘤祖 | 430年 | 288年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SHEDDEN肺癌A5生存良好 | 70年 | 32 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 尼尔森要点 | 98年 | 66年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN PILON KLF1目标 | 1972年 | 1213年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 格鲁MIR16目标 | 206年 | 127年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BILANGES血清敏感基因 | 90年 | 54 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GOBERT少突细胞分化了 | 570年 | 339年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 101 | 2584年 | 2590年 | 1 | hsa - mir - 101 | UACAGUACUGUGAUAACUGAAG |
| mir - 142 - 3 - p | 1824年 | 1830年 | m8 | hsa - mir - 142 - 3 - p | UGUAGUGUUUCCUACUUUAUGGA |
| mir - 144 | 2584年 | 2590年 | 1 | hsa - mir - 144 | UACAGUAUAGAUGAUGUACUAG |
| miR-26 | 2558年 | 2565年 | 1、m8 | hsa-miR-26a大脑 | UUCAAGUAAUCCAGGAUAGGC |
| hsa-miR-26b深圳 | UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU | ||||
| mir - 365 | 864年 | 871年 | 1、m8 | hsa - mir - 365 | UAAUGCCCCUAAAAAUCCUUAU |