基因页面:KIF13B
总结吗?
| GeneID | 23303年 |
| 象征 | KIF13B |
| 同义词 | GAKIN |
| 描述 | 驱动蛋白家族成员13 b |
| 参考 | MIM: 607350|HGNC: HGNC: 14405|运用:ENSG00000197892|HPRD: 09556|织女:OTTHUMG00000164032 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 8 p12 |
| 帕斯卡假定值 | 0.218 |
| 夏洛克假定值 | 0.195 |
| 胎儿β | -0.689 |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
| 支持 | CompositeSet Ascano FMRP目标 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| 认为:Fromer_2014 | 全外显子组测序分析 | 本研究报告623年韦斯研究精神分裂症三人小组,报告认为使用基因组DNA。 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | Psr: 0.03086 | |
| GSMA_IIE | 基因组扫描荟萃分析(欧洲血统的样品) | Psr: 0.00057 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
认为表| 基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| KIF13B | chr8 | 29025041 | T | C | NM_015254 | p.336N >年代 | 错义 | 精神分裂症 | 认为:Fromer_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs7830259 | chr8 | 14087643 | KIF13B | 23303年 | 0.08 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| FASTK | 0.77 | 0.80 |
| NDUFAF3 | 0.76 | 0.76 |
| MED29 | 0.76 | 0.75 |
| C19orf50 | 0.75 | 0.74 |
| MPV17 | 0.74 | 0.74 |
| PEX10 | 0.74 | 0.75 |
| ACAA1 | 0.74 | 0.72 |
| C9orf119 | 0.73 | 0.71 |
| COQ9 | 0.72 | 0.72 |
| MRPL17 | 0.72 | 0.70 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| EIF5B | -0.45 | -0.51 |
| AC010300.1 | -0.43 | -0.33 |
| SEC62 | -0.42 | -0.45 |
| AF347015.18 | -0.40 | -0.18 |
| AC005921.3 | -0.38 | -0.46 |
| MT-ATP8 | -0.35 | -0.16 |
| EDN1 | -0.35 | -0.17 |
| FAM159B | -0.32 | -0.43 |
| AF347015.21 | -0.32 | -0.13 |
| AP001877.2 | -0.31 | -0.27 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0000166 | 核苷酸绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0003777 | 微管马达活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0003777 | 微管马达活动 | NAS | 10859302 | |
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 10859302 | |
| 去:0005524 | ATP结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0019901 | 蛋白激酶绑定 | 新闻学会 | 10859302 | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0007165 | 信号转导 | NAS | 10859302 | |
| 去:0007018 | microtubule-based运动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0007018 | microtubule-based运动 | 助教 | 10859302 | |
| 去:0006605 | 蛋白质的目标 | 助教 | 10859302 | |
| 去:0042110 | T细胞激活 | NAS | 12496241 | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005856 | 细胞骨架 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005874 | 微管 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005875 | 微管相关的复杂 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005737 | 细胞质 | 艾达 | 10859302 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PID ARF6通路 | 35 | 27 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SOTIRIOU乳腺癌1级和3 DN | 52 | 34 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金赛的目标EWSR1 FLII融合起来 | 1278年 | 748年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 多德鼻咽癌起来 | 1821年 | 933年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 卢卡斯HNF4A目标了 | 58 | 36 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 罗德里格斯NTN1和DCC目标 | 35 | 25 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MEINHOLD卵巢癌低品位 | 19 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金正日MYC放大目标DN | 97年 | 51 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿斯顿重度抑郁症DN | 160年 | 110年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李肿瘤对胎儿肾脏1 | 182年 | 119年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿尔茨海默病了布莱洛克的 | 1691年 | 1088年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CREIGHTON内分泌治疗抵抗5 | 482年 | 296年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACEVEDO肝癌DN | 540年 | 340年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 萧述三乳腺癌基本DN | 701年 | 446年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BOQUEST干细胞培养与新鲜 | 425年 | 298年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CLIMENT乳腺癌拷贝数DN | 8 | 7 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| VANTVEER乳腺癌ESR1 | 167年 | 99年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 开罗肝脏DN发展 | 222年 | 141年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由1日EGF ZWANG瞬变脉冲 | 1839年 | 928年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-9 | 3086年 | 3092年 | 1 | hsa-miR-9深圳 | UCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGA |