概括
基因 23304
象征 UBR2
同义词 C6orf133 | BA49A4.1 | DJ242G1.1 | DJ392M17.3
描述 泛素蛋白连接酶E3成分N-验证蛋白2
参考 MIM:609134|HGNC:HGNC:21289|Ensembl:ENSG00000024048|HPRD:09853|Vega:Otthumg0000000014703
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6p21.1
Pascal P值 0.017
Sherlock P值 0.722
胎儿β 0.442
DMG 1(#研究)
主持人 小脑

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.033
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) PSR:0.04433

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG20646500 6 42536105 UBR2 2.226E-4 0.467 0.036 DMG:Wockner_2014
CG04625536 6 42533006 UBR2 5.246E-4 0.36 0.048 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
机舱1 0.71 0.76
AC091654.3 0.71 0.74
GAA 0.70 0.75
PGAP3 0.70 0.72
SMG5 0.70 0.72
clcn7 0.70 0.72
p2ry11 0.70 0.74
ZNF839 0.70 0.75
C17orf28 0.70 0.73
NDST2 0.70 0.75
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.56 -0.60
GNG11 -0.53 -0.57
C1orf54 -0.51 -0.59
AF347015.31 -0.51 -0.51
MT-CO2 -0.51 -0.51
clec2b -0.50 -0.62
AF347015.27 -0.49 -0.50
Sycp3 -0.48 -0.53
UQCRB -0.48 -0.53
AL050337.1 -0.48 -0.53

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
去:0004842 泛素 - 蛋白连接酶活性 IEA -
GO:0016874 连接酶活性 IEA -
去:0008270 锌离子结合 IEA -
GO:0046872 金属离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006511 泛素依赖性蛋白质分解代谢过程 IEA -
去:0030163 蛋白质分解代谢过程 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome适应性免疫系统 539 350 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome I类MHC介导的抗原加工表现 251 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome抗原加工泛素化蛋白酶体降解 212 129 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Davicioni分子臂与ERMS 332 228 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOOI ST7靶向DN 123 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gal白血病干细胞向上 133 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胶原蛋白凝胶DN中的Oswald造血干细胞 275 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoebeke淋巴干细胞向上 95 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1突变签名1向上 276 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1签名3 341 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vanharanta子宫肌瘤 45 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN 483 336 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
buytaert光动力疗法压力 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发6小时DN 514 330 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除 195 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shen Smarca2目标 424 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN 287 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
贝尔德糖尿病性肾病DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kyng DNA损坏紫外线 62 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损坏 226 164 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Matzuk减数分裂和DNA修复 39 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MATZUK精子细胞 72 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Coulouarn暂时TGFB1签名 109 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标2 DN 336 211 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过p38完成的phong TNF响应 227 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因