基因页：ACSL6
Summary？
| 基因ID | 23305 |
| Symbol | ACSL6 |
| 同义词 | ACS2|FACL6|LACS 6|LACS2|LACS5 |
| 描述 | 酰基-COA合成酶长链家庭成员6 |
| 参考 | MIM：604443|HGNC:HGNC:16496|ENSEMBL：ENSG00000164398|HPRD：09190|Vega：Otthumg00000150692 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 5 q31.1 |
| Pascal P值 | 0.121 |
| 胎儿β | -0.719 |
| 主持人 | 小脑半球 皮质 伏隔核基底神经节 元 |
| 支持 | G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP CompositeSet |
基因in Data Sources
Section I. Genetics and epigenetics annotation
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| pde1b | 0.95 | 0.91 |
| AC005512.1 | 0.95 | 0.67 |
| adora2a | 0.93 | 0.05 |
| WNT6 | 0.92 | 0.56 |
| LINGO3 | 0.92 | 0.77 |
| TMEM90A | 0.90 | 0.61 |
| RGS9 | 0.90 | 0.24 |
| 彭克 | 0.90 | 0.43 |
| PTPN7 | 0.89 | 0.21 |
| RGS14 | 0.89 | 0.74 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ZNF435 | -0.22 | -0.30 |
| tubb2b | -0.22 | -0.42 |
| STMN1 | -0.22 | -0.13 |
| KIAA1949 | -0.22 | -0.30 |
| CBS | -0.21 | -0.29 |
| BLVRA | -0.21 | -0.10 |
| CCDC90A | -0.21 | -0.27 |
| IGFBP2 | -0.21 | -0.31 |
| RPL38 | -0.21 | -0.60 |
| Dynlt1 | -0.21 | -0.51 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0000287 | 镁离子结合 | IEA | - | |
| 去：0003824 | 催化活性 | IEA | - | |
| 去：0004467 | 长链五酸酸-COA连接酶活性 | nas | 10548543 | |
| GO：0016874 | 连接酶活性 | IEA | - | |
| Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0008152 | 代谢过程 | IEA | - | |
| 去：0006637 | 酰基-COA代谢过程 | nas | 10548543 | |
| 去：0006629 | 脂质代谢过程 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005792 | microsome | nas | - | |
| 去：0005789 | 内质网膜 | IEA | - | |
| 去：0005739 | 线粒体 | IEA | - | |
| 去：0005741 | mitochondrial outer membrane | nas | - | |
| 去：0005777 | 过氧化物酶体 | IEA | - | |
| 去：0005778 | 过氧化物酶体膜 | nas | - | |
| 去：0005783 | 内质网 | IEA | - | |
| GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
| 去：0005886 | 质膜 | nas | 10548543 |
V.途径注释
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| Let-7/98 | 400 | 407 | 1A，M8 | HSA-LET-7A脑 | ugagguaguaguauauaguu |
| HSA-LET-7B脑 | ugagguaguagguuguguguguu | ||||
| HSA-LET-7C脑 | ugagguaguagguuguaugguu | ||||
| HSA-LET-7D脑 | AGAGGUAGUAGGUUGCAUAGU | ||||
| HSA-LET-7E脑 | ugagguaggagguuauauagu | ||||
| HSA-LET-7F脑 | ugagguagauuguauauaguu | ||||
| HSA-MIR-98脑 | UGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUU | ||||
| HSA-LET-7GSZ | ugagguaguuguuguacagu | ||||
| HSA-LET-7I脑 | ugagguaguugugugugugcugu | ||||
| miR-137 | 39 | 45 | 1a | HSA-MIR-137 | uauugcuuaagaauacgcguag |
| mir-196 | 399 | 405 | M8 | HSA-MIR-196A | uagguaguucauguugugug |
| HSA-MIR-196B | uagguaguucuuguugg | ||||
| miR-24* | 387 | 393 | 1a | HSA-MIR-189 | Gugccuacugagagauaucagu |
| miR-496 | 236 | 242 | 1a | HSA-MIR-496 | Auuacauggccaaucuc |