概括
基因 23310
象征 NCAPD3
同义词 CAP-D3 | CAPD3 | HCAP-D3 | HHCP-6 | HCP-6
描述 非SMC Condensin II复合物亚基D3
参考 MIM:609276|HGNC:HGNC:28952|Ensembl:ENSG00000151503|HPRD:11062|Vega:Otthumg00000167172
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11Q25
Pascal P值 4.957E-5
Sherlock P值 0.728
胎儿β 0.437

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM:McCarthy_2014 整个外显子组测序分析 57个三重奏的整个外显子组测序,具有零星或家族性精神分裂症。

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
NCAPD3 Chr11 134031750 一个 t NM_015261 P.I1204F 错过SNV n d 精神分裂症 DNM:McCarthy_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
COPB2 0.87 0.87
波尔克 0.87 0.88
Lman1 0.87 0.88
Scarb2 0.87 0.92
prkaa1 0.87 0.87
NBR1 0.86 0.88
UTP14C 0.86 0.88
RB1 0.86 0.86
SSR1 0.86 0.85
AppBP2 0.86 0.87
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.64 -0.69
AF347015.21 -0.63 -0.69
AF347015.31 -0.62 -0.68
FXYD1 -0.60 -0.66
ifi27 -0.60 -0.66
higd1b -0.60 -0.65
AF347015.8 -0.60 -0.67
CXCL14 -0.59 -0.67
AF347015.33 -0.59 -0.64
mt-cyb -0.59 -0.64

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
受甲基化DN调节的Missiaglia 122 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath循环基因 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard BMYB Morpholino Up 205 126 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MANALO缺氧DN 289 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TACI DN的moreaux b淋巴细胞成熟 73 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TACI DN的Moreaux多发性骨髓瘤 172 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hedenfalk乳腺癌BRCA1与BRCA2 163 113 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王顺铂响应和XPC向上 202 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由E2F4绑定的Marson未刺激 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
iwanaga癌变由Kras Pten Up 181 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞 425 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌的生存率差A6 456 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kobayashi EGFR信令24小时DN 251 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CDKN1A通过TP53的WU凋亡 55 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期G2 182 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang对GSK3抑制剂SB216763 DN的响应 374 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时 324 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Roessler肝癌转移 107 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因