基因页面:ZCCHC11
总结吗?
GeneID | 23318年 |
象征 | ZCCHC11 |
同义词 | PAPD3 | TUT4 |
描述 | 锌指CCHC-type包含11 |
参考 | MIM: 613692|HGNC: HGNC: 28981|运用:ENSG00000134744|HPRD: 15700|织女:OTTHUMG00000008200 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 1 p32.3 |
帕斯卡假定值 | 0.12 |
夏洛克假定值 | 0.27 |
胎儿β | 1.347 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 海马体 下丘脑 伏隔核基底神经节 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg07347137 | 1 | 53019316 | ZCCHC11 | 9.68 e-9 | -0.013 | 4.28 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ZCCHC11_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
CARHSP1 | 0.93 | 0.89 |
美国科学促进会 | 0.93 | 0.77 |
DBN1 | 0.93 | 0.75 |
小鼠 | 0.92 | 0.80 |
IMPDH2 | 0.92 | 0.76 |
SMARCB1 | 0.92 | 0.72 |
SLC25A1 | 0.91 | 0.88 |
C14orf93 | 0.91 | 0.83 |
WRAP53 | 0.91 | 0.74 |
MARCKSL1 | 0.91 | 0.87 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C5orf53 | -0.67 | -0.74 |
FBXO2 | -0.67 | -0.66 |
HLA-F | -0.66 | -0.65 |
ALDOC | -0.65 | -0.65 |
AIFM3 | -0.65 | -0.58 |
LDHD | -0.65 | -0.65 |
PTH1R | -0.64 | -0.60 |
CA4 | -0.64 | -0.77 |
CCNI2 | -0.63 | -0.79 |
SLC16A11 | -0.62 | -0.57 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
刘SOX4目标了 | 137年 | 94年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
武田的目标NUP98 HOXA9融合16 d DN | 143年 | 83年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
LASTOWSKA神经母细胞瘤拷贝数DN | 800年 | 473年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
通过ERCC3 DN滑落紫外线反应 | 855年 | 609年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
滑落紫外线反应通过ERCC3常见的DN | 483年 | 336年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN DELASERNA MYOD目标 | 57 | 42 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BRCA1和BRCA2 HEDENFALK乳腺癌 | 163年 | 113年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DAZARD应对紫外线这些DN | 318年 | 220年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
集群G6 DAZARD紫外线反应 | 153年 | 112年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
泰勒甲基化在急性淋巴细胞白血病 | 77年 | 52 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
COLINA 4 ebp1和4 ebp2的目标 | 356年 | 214年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
JISON镰状细胞病DN | 181年 | 97年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KOINUMA SMAD2或SMAD3的目标 | 824年 | 528年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
不是通过P38冯氏TNF响应 | 337年 | 236年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |