基因页：RPGRIP1L

概括？
基因 23322
象征 RPGRIP1L
同义词 CORS3 | FTM | JBTS7 | MKS5 | NPHP8 | PPP1R134
描述 RPGRIP1状
参考 MIM：610937|HGNC：HGNC：29168|ENSEMBL：ENSG00000103494|HPRD：17204|Vega：Otthumg00000173125
基因类型 蛋白质编码
地图位置 16Q12.2
Pascal P值 0.002
胎儿β 0.068
主持人 皮质

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV：GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中：4

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
TSN 0.92 0.90
ARMC1 0.91 0.91
VPS37A 0.90 0.89
UBA2 0.90 0.93
elp3 0.90 0.87
KPNA4 0.89 0.89
SMU1 0.89 0.87
CNOT7 0.89 0.88
RBM18 0.89 0.89
MAPKSP1 0.89 0.87
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.75 -0.75
AF347015.8 -0.73 -0.75
mt-cyb -0.72 -0.74
AF347015.33 -0.71 -0.72
AF347015.31 -0.71 -0.73
AF347015.21 -0.70 -0.72
AF347015.26 -0.70 -0.72
AF347015.2 -0.69 -0.70
AF347015.15 -0.69 -0.73
AF347015.27 -0.68 -0.71

第三节。基因本体论注释

生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007420 大脑发育 IEA 大脑（GO期限：7） -
GO：0022038 call体开发 IEA 轴突（GO术语级别：10） -
GO：0021549 小脑发育 IEA 大脑（GO期限：10） -
GO：0021772 嗅球的开发 IEA 神经元（GO期限：11） -
去：0001701 在子宫胚胎开发中 IEA -
去：0001889 肝脏发育 IEA -
去：0001822 肾脏发展 IEA -
去：0007368 确定左/右对称性 IEA -
去：0008589 调节平滑信号通路 IEA -
去：0007382 分段身份的规格，上颌段 IEA -
GO：0021532 神经管图案 IEA -
GO：0042305 分段身份，下颌段的规范 IEA -
GO：0042384 纤毛生物发生 IEA -
GO：0021670 侧心发育 IEA -
去：0043010 相机型眼睛开发 IEA -
GO：0035108 肢体形态发生 IEA -
GO：0035115 胚胎前肢形态发生 IEA -
GO：0035116 胚胎后肢形态发生 IEA -
GO：0043584 鼻子发育 IEA -
去：0060039 心包发育 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005813 中心体 艾达 17558409
去：0005737 细胞质 艾达 17558409
去：0005932 基础身体 艾达 17558409
去：0005929 纤毛 艾达 17558409
GO：0035085 纤毛轴突 艾达 17558409

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Roylance乳腺癌16Q复制号码 63 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性2 473 224 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mitsiades对aplidin的反应 439 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-103/107 1008 1015 1A，M8 HSA-MIR-103脑 agcagcauuguacggcuauga
HSA-MIR-107脑 agcagcauuguacgggcuauca
mir-125/351 1166 1172 1a HSA-MIR-125B脑 ucccugagacccuaacuuguga
HSA-MIR-125A脑 ucccugagacccuuaaccugug
mir-128 453 459 1a HSA-MIR-128A ucacagugaaccggucuuuu
HSA-MIR-128B ucacagugaaccggucuuc
mir-133 1540年 1546年 M8 HSA-MIR-133A uugguccccuucaaccagcugu
HSA-MIR-133B uguguccccuucaaccagcua
mir-136 991 997 M8 HSA-MIR-136 Acuccauuuuuuugaugaugaugga
mir-137 472 479 1A，M8 HSA-MIR-137 uauugcuuaagaauacgcguag
mir-144 451 457 M8 HSA-MIR-144 uacaguauagauguauguaguag
mir-185 1721年 1727年 1a HSA-MIR-185脑 Uggagaaaggcaguuc
mir-196 1193 1199 1a HSA-MIR-196A uagguaguucauguugugug
HSA-MIR-196B uagguaguucuuguugg
mir-203.1 1049 1055 1a HSA-MIR-203 ugaaauguuuaggaccacuag
HSA-MIR-203 ugaaauguuuaggaccacuag
mir-216 62 68 M8 HSA-MIR-216 uaaucucagcuggcaacugug
mir-217 1853年 1859年 1a HSA-MIR-217 uacugcaucagaacugauuggau
mir-22 1398 1404 1a HSA-MIR-22脑 Aagcugccaguugaagaacugu
mir-27 998 1004 1a HSA-MIR-27A脑 uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27B脑 uucacaguggcuaaguucugc
HSA-MIR-27A脑 uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27B脑 uucacaguggcuaaguucugc
mir-28 1308 1314 1a HSA-MIR-28脑 Aaggagcucacagucuauugag
mir-323 498 504 M8 HSA-MIR-323脑 gcacauuacggucgaccucu
mir-34/449 197 203 1a HSA-MIR-34A脑 uggcaguguuaguguguuuu
HSA-MIR-34C Aggcaguguaguagcugauugc
HSA-MIR-449 uggcaguguauuguagcuggu
HSA-MIR-449B Aggcaguguauuguuagcuggc
mir-377 1275 1281 M8 HSA-MIR-377 aucacacaaaggaacuuuuugu
mir-381 150 156 1a HSA-MIR-381 uauacaagggcaagcucucugu
mir-409-3p 1321 1328 1A，M8 HSA-MIR-409-3P cgauauguugcucggugaaccccu
mir-452 1125 1132 1A，M8 HSA-MIR-452 UguuugcaggaaacugagaC
mir-488 900 906 M8 HSA-MIR-488 cccagauauggcacucucucaa
mir-495 1748年 1754年 M8 HSA-MIR-495脑 Aaacaaacauggugcacuuuuu
mir-496 1155 1161 1a HSA-MIR-496 Auuacauggccaaucuc