基因页：CLASP1

Summary？
基因 23332
象征 CLASP1
同义词 MAST1
描述 细胞质接头相关蛋白1
Reference MIM：605852|HGNC：HGNC：17088|Ensembl:ENSG00000074054|HPRD:09322|Vega:OTTHUMG00000153331
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2Q14.2-Q14.3
Pascal P值 0.139
Sherlock p-value 0.882
胎儿β 0.909
DMG 2（＃研究）
支持 CompositeSet
Darnell FMRP目标
Ascano FMRP目标

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 3
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 3
GSMA_I Genome scan meta-analysis Psr: 0.023
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析（所有样品） PSR：0.00755

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG20340149 2 122407145 CLASP1 1.066E-4 -0.209 0.028 DMG：Wockner_2014
cg14574905 2 122176293 CLASP1 3.483E-4 0.358 0.041 DMG：Wockner_2014
CG01297674 2 122406765 CLASP1 3.03e-9 -0.017 2.09E-6 DMG：JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SNX17 0.87 0.90
C20ORF29 0.87 0.86
rpusd3 0.86 0.84
ACTR1B 0.86 0.85
RHBDD2 0.85 0.88
UBL7 0.85 0.86
ABHD14A 0.85 0.84
trub2 0.84 0.87
P4HTM 0.84 0.84
C20ORF30 0.84 0.87
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
EIF5B -0.57 -0.64
AC010300.1 -0.49 -0.57
AC005921.3 -0.48 -0.66
AF347015.18 -0.47 -0.32
NSBP1 -0.45 -0.42
anp32c -0.43 -0.45
ZNF326 -0.39 -0.35
AC100783.1 -0.39 -0.31
HSP90AB4P -0.38 -0.42
SFRS18 -0.38 -0.52

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005515 蛋白质结合 IPI 15631994|17342765
GO：0051010 微管加末端结合 艾达 12837247
GO：0043515 kinetochore binding IMP 12837247
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0001578 微管束的形成 IMP 12837247
去：0007026 微管解聚的负调节 Igi 15631994
去：0007026 微管解聚的负调节 IMP 16866869
去：0007163 细胞极性的建立或维护 nas 15928712
去：0007049 cell cycle IEA -
去：0007067 mitosis IEA -
GO：0010458 exit from mitosis IMP 16866869
去：0051301 细胞分裂 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0000777 凝结的染色体动力学 IEA -
去：0005794 高尔基体 艾达 15631994
GO:0005828 动力学微管 TAS 12837247
去：0005856 细胞骨架 IEA -
去：0005881 细胞质微管 艾达 11290329
去：0005737 cytoplasm IEA -
去：0030981 皮质微管细胞骨架 艾达 12837247
GO：0031592 centrosomal corona 艾达 16914514

Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 2.0 # SZGR基因in pathway 信息
Reactome发育生物学 396 292 All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组细胞周期 421 253 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome细胞周期有丝分裂 325 185 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome募集有丝分裂的中心体蛋白和复合物 66 43 All SZGR 2.0 genes in this pathway
来自有丝分裂中心体NLP的反应组损失 59 38 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome Axon指导 251 188 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Robo受体的反应组信号传导 30 26 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome有丝分裂M M G1相 172 98 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome有丝分裂G2 G2 M相 81 50 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome DNA复制 192 110 All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组有丝分裂起点 87 51 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Sengupta鼻咽癌 294 178 All SZGR 2.0 genes in this pathway
多德鼻咽癌DN 1375 806 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LUI甲状腺癌PAX8 PPARG UP 44 29 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LUI甲状腺癌簇1 51 33 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN 483 336 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伊万诺娃造血早期祖先 532 309 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ULE SPLICING VIA NOVA2 43 38 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dazard对UV NHEK DN的反应 318 220 All SZGR 2.0 genes in this pathway
dazard UV响应集群G6 153 112 All SZGR 2.0 genes in this pathway
OUILLETTE CLL 13Q14删除 74 40 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Cheng由雌二醇印记 110 68 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YAGI AML WITH T 9 11 TRANSLOCATION 130 87 All SZGR 2.0 genes in this pathway
winnepenninckx黑色素瘤转移 162 86 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Linsley mir16目标 206 127 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 miRNA ID mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
miR-135 229 235 1a HSA-MIR-135A Uauggcuuuuuuuuccuauga
HSA-MIR-135B Uauggcuuuucauuccuaugug
mir-181 161 168 1A，M8 HSA-MIR-181Abrain AACAUUCAACGCUGUCGGUGAGU
HSA-MIR-181BSZ aacauucauugcugucggggg
HSA-MIR-181Cbrain aacauucaaccugucggugagu
HSA-MIR-181Dbrain aacauucauuguugucggggguggguu
mir-194 2918 2924 1a HSA-MIR-194 uguaacagcaacuccauga
miR-200bc/429 115 121 M8 hsa-miR-200b uaauacugccugguaaugaugac
hsa-miR-200c UAAUACUGCCGGGUAAUGAUGG
hsa-miR-429 UAAUACUGUCUGGUAAAACCGU
mir-214 256 263 1A，M8 hsa-miR-214brain acagcaggcacagacaggcag
mir-219 110 116 1a hsa-miR-219brain UGAUUGUCCAAACGCAAUUCU
mir-320 133 139 M8 hsa-miR-320 aaaagcugggugagaggggcgaa
mir-323 2999 3005 M8 hsa-miR-323brain gcacauuacggucgaccucu
miR-370 1844年 1850年 1a HSA-MIR-370brain gccugggggguggaaccugg
miR-493-5p 2978 2984 M8 HSA-MIR-493-5p uuguacaugguaggcuuucauu
miR-494 2950 2956 1a HSA-MIR-494brain ugaaacauacgggaaaccucuu