基因页：SZT2

概括？
基因 23334
象征 SZT2
同义词 c1orf84 | eiee18 | kiaa0467 | szt2a | szt2b
描述 癫痫发作阈值2同源物（鼠标）
参考 MIM：615463|HGNC：HGNC：29040|ENSEMBL：ENSG00000198198|HPRD：11085|Vega：Otthumg00000007423
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p34.2
Pascal P值 3.671E-5
TADA P值 0.007
胎儿β -0.231
支持 COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM：XU_2012 整个外显子组测序分析 在这项研究中，通过795个样品的外显子组测序鉴定了4个基因的从头突变

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 筛 CG46 特征 学习
SZT2 CHR1 43891777 C CCA NM_015284 。 边框 精神分裂症 DNM：XU_2012


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FADS2 0.78 0.84
FAM59B 0.74 0.83
PVRL2 0.74 0.78
SEMA4B 0.73 0.82
CNTFR 0.72 0.79
AL161668.2 0.71 0.77
SMTN 0.70 0.75
SLC19A1 0.70 0.74
AC130686.2 0.69 0.78
C1orf56 0.69 0.68
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
KRT222P -0.56 -0.57
chn1 -0.54 -0.52
ACOT13 -0.52 -0.57
KBTBD3 -0.52 -0.64
KMO -0.52 -0.56
PPP4R4 -0.51 -0.54
serpini1 -0.50 -0.50
cacna1f -0.50 -0.56
RGS4 -0.50 -0.52
FAM162A -0.50 -0.56

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Ginestier乳腺癌Znf217扩增DN 335 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ginestier乳腺癌20Q13扩增DN 180 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
屏障癌复发肿瘤样品DN 13 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘肝癌 38 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因