基因页：AFF2

概括？
基因 2334
象征 AFF2
同义词 fmr2 | fmr2p | fraxe | mrx2 | ox19
描述 AF4/FMR2家庭成员2
参考 MIM：300806|HGNC：HGNC：3776|Ensembl：ENSG00000155966|HPRD：02397|Vega：Otthumg0000000022613
基因类型 蛋白质编码
地图位置 XQ28
Sherlock P值 0.137
胎儿β 2.166
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 潜在的突触基因

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV：GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中：1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS7584986 CHR2 184111432 AFF2 2334 0.05 反式
RS16955618 CHR15 29937543 AFF2 2334 1.195E-4 反式
RS1041786 CHR21 22617710 AFF2 2334 0.01 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
HCK 0.83 0.71
CD68 0.81 0.72
CD14 0.81 0.75
ITGB2 0.80 0.74
trem2 0.79 0.75
FCGR1A 0.76 0.64
VSIG4 0.76 0.68
NCKAP1L 0.76 0.67
laptm5 0.75 0.76
PGD 0.74 0.74
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AC010300.1 -0.30 -0.41
AC005921.3 -0.26 -0.39
AF347015.18 -0.26 -0.21
AP000769.2 -0.26 -0.35
AF347015.26 -0.26 -0.21
Malat1 -0.26 -0.33
AC016705.1 -0.26 -0.31
C10orf108 -0.25 -0.30
ERVWE1 -0.25 -0.31
micall2 -0.24 -0.23

第三节。基因本体论注释

生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007420 大脑发育 塔斯 大脑（GO期限：7） 8673086
去：0007611 学习或记忆 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005634 核 艾达 18029348
去：0005737 细胞质 艾达 18029348

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Casorelli急性临时细胞白血病 177 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC网络 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ross AML与PML RARA FUSION 77 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染6小时 71 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1靶向DN 543 317 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53目标DN 593 372 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向DN 591 366 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Valk AML群集12 30 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染1小时 61 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rattenbacher由Celf1绑定 467 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-103/107 4499 4506 1A，M8 HSA-MIR-103脑 agcagcauuguacggcuauga
HSA-MIR-107脑 agcagcauuguacgggcuauca
mir-140 2907 2913 1a HSA-MIR-140脑 agugguuuuacccuaugguag
mir-142-3p 163 170 1A，M8 HSA-MIR-142-3P uguaguuuccuacuuuaugga
mir-145 3586 3592 M8 HSA-MIR-145 guccaguuucccaggaaucccuu
mir-149 1740年 1746年 1a HSA-MIR-149脑 Ucuggcuccucuucuucacuccc
HSA-MIR-149脑 Ucuggcuccucuucuucacuccc
mir-150 3575 3581 1a HSA-MIR-150 ucucccaacccuuguaccagug
mir-188 2696 2702 1a HSA-MIR-188 cucccuugcaugguggggu
mir-214 1530 1536年 M8 HSA-MIR-214脑 acagcaggcacagacaggcag
mir-218 5631 5637 1a HSA-MIR-218脑 uugugcuugaucuaaccaugu
mir-24 3753 3759 1a HSA-MIR-24SZ uggcucucagagcaggaagag
mir-320 1902年 1908年 1a HSA-MIR-320 aaaagcugggugagaggggcgaa
mir-328 2869 2875 M8 HSA-MIR-328脑 cuggcccucugccuuccgu
mir-33 9301 9307 1a HSA-MIR-33 Gugcauuguuguugcauug
HSA-MIR-33B Gugcauugcuguugcauugca
mir-346 3785 3791 M8 HSA-MIR-346脑 ugucugccccgcaugccugccucu
mir-361 3996 4002 M8 HSA-MIR-361脑 uuaucagaaucuccagggguac
mir-369-3p 7116 7122 M8 HSA-MIR-369-3P aauauacaugguugaucuuu
mir-409-3p 1413 1419 1a HSA-MIR-409-3P cgauauguugcucggugaaccccu
mir-448 226 232 M8 HSA-MIR-448 uugcauauguaggauguccccau
mir-452 1630 1636年 M8 HSA-MIR-452 UguuugcaggaaacugagaC
mir-494 4334 4340 1a HSA-MIR-494脑 ugaaacauacgggaaaccucuu
mir-495 108 114 M8 HSA-MIR-495脑 Aaacaaacauggugcacuuuuu
mir-539 232 239 1A，M8 HSA-MIR-539 ggagaauuauccuuggugugu