概括
基因 23344
象征 esyt1
同义词 FAM62A | MBC2
描述 扩展突触蛋白蛋白1
参考 MIM:616670|HGNC:HGNC:29534|ENSEMBL:ENSG00000139641|HPRD:14367|Vega:Otthumg00000170197
基因类型 蛋白质编码
地图位置 12q13.2
Pascal P值 0.685
Sherlock P值 0.238
胎儿β -1.565
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG14752451 12 56525349 esyt1 3.528E-4 0.476 0.042 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS11851301 CHR14 95174265 esyt1 23344 0.17 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CBY1 0.85 0.83
RANBP1 0.84 0.84
DUSP12 0.84 0.84
BAT1 0.84 0.82
IFT52 0.83 0.86
EIF4A3 0.83 0.81
Dynlt1 0.83 0.81
DNAJC9 0.83 0.77
PPP4C 0.83 0.84
粉丝 0.83 0.81
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
HLA-F -0.69 -0.72
tinagl1 -0.67 -0.75
AF347015.27 -0.67 -0.74
AF347015.33 -0.66 -0.75
FBXO2 -0.65 -0.66
MT-CO2 -0.65 -0.73
AF347015.15 -0.65 -0.76
mt-cyb -0.64 -0.74
AF347015.8 -0.64 -0.74
PTGD -0.64 -0.72

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
刘cmyb靶向 165 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1突变签名1 DN 126 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1签名3 DN 162 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mattioli Mgus vs PCL 116 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 DN 163 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUAN对TNF DN的反应 84 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN 287 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Brachat对Camptothecin DN的反应 46 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein Pons标记 89 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein Medulla标记 81 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王肿瘤的侵入性DN 210 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hinata NFKB靶向角质形成细胞DN 23 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI假足趋化性DN 457 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病持续时间corr dn 146 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Acosta增殖独立MYC目标DN 116 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因